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宏基因组测序技术检测胎菊饮片表面微生物污染方法研究

文献类型： 中文期刊

作者： 车阳;李樱红;李宏;刘淑艳;高雯雯;武雅文;王焕英;孙玲莉;邱晓力;方序;王庭璋

作者机构：

关键词： 胎菊;宏基因组测序;表面微生物

期刊名称：中国现代应用药学

ISSN： 1007-7693

年卷期： 2022 年 39 卷 15 期

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; CSCD（2021-2022年度） ; 科技核心（2021版）

摘要： 目的 建立基于宏基因组测序技术检测胎菊表面微生物含量的方法,检测市售中药饮片胎菊微生物污染情况,探索微生物污染途径和来源。方法 利用宏基因组测序比较市售胎菊样品培养组与非培养组之间的表面微生物检出差异,并运用宏基因组测序技术检测2款胎菊商品的表面微生物含量。检测杭州原种场和桐乡新鲜胎菊样品的表面微生物种类,并比较新鲜样品与商品表面微生物种类及相对含量差异。结果 相较于培养组,宏基因组测序技术可以从非培养组中检出更多真菌和古菌。2款胎菊商品表面均检出条件致病菌,饮片表面的微生物与同产地新鲜胎菊样品表面微生物组成相近,表明污染可能来自于种植环境。结论 市售胎菊商品中存在微生物污染情况,宏基因组测序方法可以有效检测胎菊饮片表面微生物,可作为中药饮片微生物污染监测、中药饮片污染微生物数据库构建的有力工具,进而为提高中药饮片的用药安全奠定技术基础。

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