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犬乳铁蛋白基因克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 李航;陈宗艳;刘光清;李传峰

作者机构：

关键词： 犬乳铁蛋白;基因克隆;序列分析;生物信息学分析

期刊名称：中国动物传染病学报

ISSN： 1674-6422

年卷期： 2021 年 29 卷 6 期

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; 农林核心（2020版） ; 科技核心（2020版）

摘要： 本研究旨在克隆犬乳腺组织中犬乳铁蛋白(LTF)基因CDS序列并进行详尽的生物信息学分析,为下一步的研究奠定基础.从犬乳腺组织中扩增得到LTF CDS全长,并克隆至pGEX-4T-1原核表达载体,利用双酶切与测序验证重组质粒pGEX-4T-LTF,最后使用生物信息学软件对LTF进行生物信息学分析.结果显示,成功克隆了全长2127 bp的LTF的CDS;LTF属于可溶性蛋白,分子质量为77 kDa,等电点为8.62;二级结构中α-螺旋(Hh)占36.44％,延长链(Ee)占15.11％,无规则卷曲(Cc)占48.45％;三级结构中无规则卷曲较多,α-螺旋与β-折叠较为集中;跨膜区分析得知LTF蛋白708个氨基酸全部位于细胞膜表面;信号肽预测剪切位点位置在犬LTF基因蛋白的第19-20位;B细胞表位预测表明,有5个潜在的B细胞优势表位.本研究结果可为犬乳铁蛋白生物学功能研究以及开发利用提供详实的数据支持.

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