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肉鸡屠宰性状全基因组关联分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王一东;陈智武;黄超;粟永春;余洋;崔焕先;郑麦青;赵桂苹;文杰;王述柏

作者机构：

关键词： 肉鸡;屠宰性状;全基因组关联分析;单核苷酸多态性

期刊名称：中国家禽

ISSN： 1004-6364

年卷期： 2023 年

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; ; 科技核心（2023版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： 为研究影响肉鸡屠宰性状选育的主要遗传因素，试验采用全基因组关联分析（Genome-wide association study,GWAS）挖掘与屠宰性状相关的单核苷酸多态性（Single nucleotide polymorphism,SNP）位点和候选基因。以264只金陵花鸡终端父系公鸡为试验材料，采集血液提取DNA，使用全基因组重测序技术获取个体基因型数据，使用PLINK 1.90软件对基因型数据进行质量控制。对宰前体重、屠体重、半净膛重、全净膛重4个性状进行屠宰测定，使用EXCEL和R语言进行正态分布检验和相关性分析。使用GEMMA软件进行GWAS分析，定位出显著的SNP位点。使用SPSS软件分析屠宰性状的有利基因型。结果显示：屠宰性状均符合正态分布，相关度在0.96以上。定位到4个显著的SNP位点，注释到一个基因为RAB6A。1和3号染色体显著位点TT为有利基因型，19号染色体上显著位点CC为有利基因型。研究提示：应根据挖掘到的显著SNPs和候选基因进行屠宰性状的选择，加强肉鸡屠宰性状分子育种的理论基础以提高屠宰加工型肉鸡的选择进展。

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