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基于水稻原生质体的染色质免疫共沉淀技术优化及应用

文献类型： 中文期刊

作者： 石佳;朱秀梅;薛梦雨;余超;魏一鸣;杨凤环;陈华民

作者机构：

关键词： 水稻原生质体;染色质免疫共沉淀技术;转录因子;OsNF-YA4;ChIP-RP

期刊名称：生物技术通报

ISSN： 1002-5464

年卷期： 2022 年

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; CSCD（2021-2022年度） ; 科技核心（2021版） ; 农林核心（2020版）

摘要： 植物转录因子是植物体内调节基因表达的重要蛋白，参与多种生物学功能的调控。研究植物转录因子调控靶基因的常用方法为染色质免疫共沉淀法（chromatin immunoprecipitation,ChIP），但抗体特异性、遗传材料构建的耗时性等因素却大大限制了ChIP技术的应用范围和效果。本文通过对水稻原生质体瞬时转化、甲醛固定、免疫沉淀核酸的超声波破碎等条件的优化，建立了基于水稻原生质体的染色质免疫共沉淀技术体系（chromatin immunoprecipitation system based on rice protoplasts,ChIP-RP）；并通过本技术体系验证了水稻转录因子OsNF-YA4蛋白对靶基因序列的富集作用。本技术体系将减少制备特异性抗体或构建稳定遗传材料的局限，有利于水稻转录因子直接调控靶基因的快速筛选和验证，推动水稻转录因子调控功能的分子机制解析。

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