猪流行性腹泻病毒SYBR Green I实时荧光定量PCR检测方法的建立
文献类型: 中文期刊
作者: 董苏洁;孔宁;秦文珍;翟焕杰;翟雪滢;杨心雨;童武;郑浩;于海;童光志;李有文;单同领
作者机构:
关键词: 猪流行性腹泻病毒;N基因;SYBR Green I;荧光定量PCR
期刊名称:中国动物传染病学报
ISSN: 1674-6422
年卷期: 2022 年
页码:
收录情况: 北大核心(2020版) ; 科技核心(2021版) ; 农林核心(2020版)
摘要: 为了建立高效、灵敏的猪流行性腹泻病毒(PEDV)检测方法,本研究从GenBank数据库中获取PEDV N基因序列,扩增出PEDV N基因标准质粒,并在N基因的保守区域内设计了一对特异性荧光定量引物,成功建立了SYBR Green I实时荧光定量PCR检测方法。经过一系列试验表明,该检测方法线性关系良好,R2值为0.99;特异性强,敏感性高,最低可检测至2.23拷贝/μL, 比普通PCR灵敏约100倍;重复性好,组内变异系数在0.25%~0.43%之间,组间变异系数在0.67%~0.97%之间;对于各地区96份临床样品检测出PEDV阳性率为25%。本研究建立的实时荧光定量PCR检测方法为PEDV的临床诊断、流行病学调查以及定量研究提供了有效的检测工具。
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