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2023年吉林省、山东省和内蒙古自治区三株鸭圆环病毒遗传变异分析

文献类型： 中文期刊

作者： 胡静雷;王笑焓;王振军;刘成;何曼琳;孙雍阳;师少文;任文浩;王玉星;聂小萱;熊娜;黄凯俊;郭振东;李楠;赵宗正;武军元

作者机构：

关键词： 鸭圆环病毒;遗传进化;序列分析

期刊名称：特产研究

ISSN： 1001-4721

年卷期： 2024 年

页码：

收录情况： 科技核心（2024版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： 为了解来自山东、内蒙古、吉林地区养殖场的3份鸭病料中鸭圆环病毒（Duck circovirus, DuCV）的遗传进化规律、基因型和变异情况。本研究运用DNAstar、RDP4、SimPlot、MEGA和BioEdit等软件对3株DuCV进行了同源性、重组、遗传进化、氨基酸突变和序列分析。通过分析发现3株鸭圆环病毒的基因型均为鸭圆环病毒1型（DuCV-1），核苷酸同源性为99.20%～99.50%，与广东OR842550、广西OR134489和越南OM176553遗传距离最近且同源性最高。与2003年德国DuCV-1型代表株AY22855相比，3株鸭圆环病毒的Cap蛋白均发生了5个氨基酸突变，分别是R82Q,S106N,T107K,G194T,N236D。通过DNAstar对抗原表位预测分析，除了N236D突变，其余4个突变均位于DuCV的Cap蛋白的抗原表位区，可能会导致病原抗原漂移。还发现2019年后报道的部分鸭圆环病毒Cap蛋白也出现了以上这5个氨基酸位点突变，表明这5个突变可能是DuCV进化过程中发生的固有突变。以上结果表明，2019年以后的部分DuCV的Cap蛋白发生5个固有变异，这些变异可能与鸭圆环病毒的抗原性、病毒毒力和致病性有关，同时也提示我们应当加强对DuCV的监测。

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