文献类型： 中文期刊
作者： 董宁宁;张琦;谈晓梅;孙亚娟;李传峰;朱杰;汤傲兴;张达;刘光清;李永畅;孟春春
作者机构：
关键词： 猫;DDX20蛋白;克隆;生物信息学分析
期刊名称：中国动物传染病学报
ISSN： 1674-6422
年卷期： 2024 年
页码：
收录情况： 北大核心（2023版） ; ; 科技核心（2024版） ; ; 农林核心（2020版）
摘要： 本研究对猫DDX20的CDS区进行克隆、比对不同物种DDX20核苷酸序列和氨基酸序列，构建系统发育树，利用ExPASy ProtParam、DeepTMHMM等软件或在线工具对DDX20蛋白理化性质、二级结构等预测分析，并在mRNA水平上判断猫杯状病毒（FCV）对猫DDX20的影响。结果表明：成功克隆出猫DDX20基因CDS区，并上传GenBank，获得登录号：OR237969。生物信息学分析结果显示，猫DDX20蛋白为亲水性蛋白，无跨膜螺旋区和信号肽，有92个潜在的磷酸化修饰位点，3个潜在的N-糖基化位点和7个潜在的O-糖基化位点。亚细胞定位分析显示猫DDX20蛋白主要分布在细胞核（65.2%）。进化分析表明，猫DDX20与老虎和豹子同源性较高。FCV感染会导致猫DDX20的mRNA水平升高，或对病毒的复制产生影响。本研究成功克隆猫DDX20基因CDS区，为后续猫DDX20蛋白功能研究奠定基础。
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