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基于SNP标记的橹稻与栽培稻的遗传多样性分析及萌发耐淹性评价

文献类型： 中文期刊

作者： 孙志广;潘根;陈庭木;李景芳;赵利君;迟铭;徐波;邢运高;刘金波;刘晓敏;葛高宁;徐锦涛;王宝祥;徐大勇

作者机构：

关键词： 橹稻;栽培稻;SNP;遗传多样性;萌发耐淹性

期刊名称：中国农学通报

ISSN： 1000-6850

年卷期： 2022 年 30 期

页码：

收录情况： 科技核心（2021版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： 旨在分析橹稻与栽培稻间的遗传多样性,为橹稻的保护和开发利用提供分子依据.以包括橹稻在内的48份水稻种质资源为试验材料,利用1K mGPS SNP芯片进行基因分型,使用PowerMaker 3.25软件进行UPGMA聚类分析.结果表明,4785对多态性SNP标记共检测出9570个等位基因,平均每对标记检测出2个等位变异;多态性信息含量(PIC)变化范围为0.0400～0.5957,平均值为0.3123,基因多样性指数(GD)变化范围为0.0408～0.6667,平均值为0.3839.UPGMA聚类分析将48份参试种质划分为2个亚群,即籼稻亚群和粳稻亚群,其中橹稻分属于粳稻亚群.厌氧萌发耐受性评价表明,橹稻具有很强的耐低氧萌发能力,可为适宜直播水稻的培育提供重要的种质基础,同时本研究为橹稻优异基因的挖掘和利用提供理论基础.

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