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玉米愈伤组织形成的转录组分析

文献类型： 中文期刊

作者： 贾思年;魏倩涵;苗蓉;彭云玲;刘允军

作者机构：

关键词： 玉米;愈伤形成;转录组测序;激素信号转导;转录因子

期刊名称：植物遗传资源学报

ISSN： 1672-1810

年卷期： 2023 年 4 期

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; ; CSCD（2023-2024年度） ; ; 科技核心（2023版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： 玉米遗传转化受体主要是未成熟幼胚,经过组织培养形成胚性愈伤组织,进而分化成苗.目前,对玉米胚性愈伤组织形成的分子机理的了解还不深入.为了挖掘调控玉米胚性愈伤组织形成的基因,本研究选取玉米自交系CAL28×郑58的F3群体中不同表型的愈伤组织进行RNA-seq分析.与愈伤发生差的Ⅱ型愈伤相比,愈伤发生好的Ⅰ型愈伤中共检测到4419个差异表达基因,其中1571个基因上调,2848个基因下调.GO富集分析结果表明,差异表达基因主要富集在细胞过程、催化活性、细胞组分等通路中.KEGG富集分析表明,差异表达基因主要富集在苯丙烷生物合成途径和植物激素信号转导途径.在生长素早期响应基因中,8个AUX/IAA家族基因,如IAA23、IAA33、IAA41,和4个GH3家族基因在Ⅰ型愈伤中上调表达.差异显著基因中共有隶属56个转录因子家族的2968个转录因子,其中与愈伤形成相关的AP2、WOX和LBD转录因子家族基因中的ZmEREB53、ZmEREB206、ZmEREB 184、ZmLBD10、ZmLBD24、ZmLBD31、ZmLBD32、ZmWOX5b、ZmWOX9b 等在Ⅰ型愈伤 中的表达量显著上调,对这些靶标基因进行遗传操作有可能促进玉米愈伤组织形成.本研究发现的靶标基因具有较大的应用潜力,研究结果也为解析玉米愈伤组织形成的分子机理提供了理论参考.

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