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草莓病毒1山东分离物全基因组分析

文献类型： 中文期刊

作者： 何成勇;赵晓丽;许腾飞;高德航;李世访;王红清

作者机构：

关键词： 草莓;草莓病毒1;基因组全长;高通量测序

期刊名称：园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2022 年

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; ; CSCD（2021-2022年度） ; ; 科技核心（2021版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： 草莓病毒1（strawberry virus 1，StrV-1）属于弹状病毒科（Rhabdoviridae）细胞质弹状病毒属（Cytorhabdovirus），可侵染草莓。利用高通量测序（high-throughput sequencing，HTS）结合RT-PCR和RACE技术从采自山东省烟台市乳山市草莓种植基地的草莓品种‘全明星’上获得了StrV-1山东分离物（StrV-1-CN）的基因组全长（GenBank登录号：MW795715）。该分离物基因组全长为14 051 nt，3’和5’非编码区序列分别为181和767 nt，其负义链含有9个开放阅读框（open reading frame，ORF），从3’到5’端分别编码N、P’、P、P3、M、G、P6、P7和L等9个蛋白。序列分析表明，StrV-1-CN与已报道的StrV-1分离物基因组全长核苷酸序列一致性为77% ～ 88%。系统发育分析结果表明，StrV-1-CN与捷克分离物B和1/2017聚在一个分支，亲缘性最近。

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