基于网络药理学研究板蓝根抑菌活性成分及其作用机制
文献类型: 中文期刊
作者: 田薇;李秀梅;杨娟;王小莹;周炜炜;李中媛;戴小枫
作者机构:
关键词: 板蓝根;网络药理学;抑菌活性;作用机制
期刊名称:畜牧兽医学报
ISSN: 0366-6964
年卷期: 2022 年
页码:
收录情况: 北大核心(2020版) ; CSCD(2021-2022年度) ; 科技核心(2021版) ; 农林核心(2020版)
摘要: 旨在基于网络药理学研究板蓝根的主要抑菌药效成分及其作用机理。利用中药系统药理学在线分析数据库(TCMSP)筛选出板蓝根药效成分及其潜在作用靶点,通过OMIM和GeneCards数据库以“抑菌”为关键词搜索相关靶点。通过Venny平台获取板蓝根和抑菌的交集靶点。通过STRING数据库结合Cytoscape软件构建PPI网络图并筛选关键靶点。通过DAVID数据库进行GO功能富集和KEGG通路富集分析。通过Autodock Tools 1.5.7软件将关键药效成分和抑菌靶点进行分子对接。通过菌落计数法和SDS-PAGE法验证关键药效成分抑菌作用和作用靶点。结果显示:共筛选到药效成分33个,药物靶点61个,抑菌靶点2 192个,药物与抑菌作用交集靶点32个。蛋白互作网络分析发现TNF、TP53、CASP3、JUN、ESR1、PTGS2等30个蛋白可能是板蓝根抑菌作用的关键靶点。GO功能富集分析得到126个条目,包括生物过程条目86个(如对雌二醇的反应、凋亡信号通路、神经元凋亡过程的正调控),细胞组分条目11个(如细胞质、核),分子功能条目29个(如蛋白质同源二聚化活性、酶结合)。KEGG通路富集分析得到20条通路。分子对接结果显示,度值排名前3位的活性成分(β-谷甾醇、豆甾醇、金合欢素)与关键抑菌靶点编码蛋白的结合能均小于0 kJ·mol-1。抑菌试验验证表明,豆甾醇是板蓝根的关键药效成分,其能够下调胞内CASP3和PTGS2蛋白的表达。板蓝根主要通过药效成分豆甾醇作用于PTGS2、CASP3靶点,通过TNF、癌症途径信号通路发挥抑菌作用。
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