文献类型： 中文期刊
作者： 冷超粮;马秀秀;宋佳静;王佳宝;贾楠;田想;刘华;李峻婕;段竹君;刘思;翟洪月;张腾;史鸿飞;李娜;姚伦广;阚云超;田志军
作者机构：
关键词： 猪圆环病毒2型;流行病学调查;序列分析;Cap蛋白;遗传变异
期刊名称：中国预防兽医学报
ISSN： 1008-0589
年卷期： 2024 年
页码：
收录情况： 北大核心（2023版） ; ; CSCD（2023-2024年度） ; ; 科技核心（2024版） ; ; 农林核心（2020版）
摘要： 为了解河南省新发猪圆环病毒2型(PCV2)的流行及变异情况，本研究采集该地区规模化猪场2017年1月～2023年6月939份表现繁殖障碍和呼吸道疾病的病猪血液或组织样品，采用PCR方法进行PCV2检测。结果显示，PCV2总体阳性率为31.42%(295/939)。其中，2017年～2022年PCV2阳性率逐年降低，分别为58.65%(61/104)、49.48%(48/97)、28.57%(36/126)、16.15%(31/192)、11.52%(19/165)和7.87%(7/89)，而2023年迅速上升，达到56.02%(93/166)。为进一步分析PCV2新病毒株的遗传变异特征，利用PCR扩增29份PCV2阳性样品的全基因组，并测序。采用MegAlign分析PCV2流行株全基因组与GenBank中4株PCV2参考株全基因组序列的同源性；采用MEGA 11软件利用NJ法构建PCV2流行株ORF2基因与GenBank中24株PCV2参考株ORF2基因的系统发育树；采用MegAlign分析PCV2流行株Cap蛋白氨基酸序列的变异特征；采用RDP4和SimPlot分析PCV2流行株全基因组的重组特征。全基因组同源性分析结果显示，本研究鉴定的PCV2全基因组之间的同源性为95.1%～100%，与参考株的同源性为93.7%～98.6%，其中与疫苗株PCV2a LG(HM038034)、 PCV2b DBN-SX07-2(HM641752)和PCV2d SH(AY686763)的同源性分别为94.8%～96.2%、95.3%～98.6%和96.6%～97.8%，与来自丹麦的代表株PCV2c DK1980PMWSfree株(EU148503)同源性为93.7%～95.1%。此外，两株2023年的PCV2流行株HN230522和HN231217株变异较大，与参考株的同源性仅为94.5%～97.9%。进化树结果显示，有19株PCV2流行株与PCV2d基因型参考株聚为一个分支，10株与PCV2b基因型参考株聚为一个分支。其中今年出现的PCV2流行株HN230522和HN231217株虽然属于PCV2d基因型，但处于一个相对独立的分支。Cap蛋白氨基酸序列分析结果显示，与疫苗株PCV2a LG(HM038034)、PCV2b DBN-SX07-2(HM641752)或PCV2d SH(AY686763)相比，部分PCV2流行株在构象表位区(aa47～aa85和aa165～aa200)存在R48H、A59K/R、G85D、P151T、N178S、R180K和G197S的突变，在基因型特异性结构域(aa190～aa191/aa206/aa210)，存在K206I的突变。而且，HN230522株在核定位信号区(NLS)(aa1～aa41)存在特有的V30L突变，HN231217株在基因型特异性结构域(aa89～aa91)存在特有的89RTV91残基。重组分析结果显示，有高达65.52%(19/29)的PCV2流行株可能有疑似的重组片段，且重组片段全部位于ORF1。上述结果表明，今年以来河南省猪场PCV2阳性率快速上升，且流行株出现了较大变异，可能逃逸了疫苗诱导机体的免疫保护，应加强对PCV2流行动态和遗传变异的监测。本研究为河南省PCV2分子流行病学、疫苗研究和相关疫病的有效防控提供参考依据。
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