数字农科院2.0

广西地方猪群体遗传结构、选择信号分析和ROH检测

文献类型： 中文期刊

作者： 莫家远;李月月;路玉洁;史良玉;刘笑笑;陈奎蓉;綦文晶;朱思燃;奉玲丽;梁晶;兰干球

作者机构：

关键词： 广西地方品种 ; 商业猪种 ; 群体遗传结构 ; 选择信号 ; ROH

期刊名称：中国畜牧杂志

ISSN： 0258-7033

年卷期： 2021 年 57.0 卷 z1 期

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; 农林核心（2020版） ; 科技核心（2020版）

摘要： 为深入挖掘广西地方猪种的种质特性相关基因,用50K芯片对巴马香猪和隆林猪进行了基因分型,并下载了陆川猪、东山猪、杜洛克、长白猪和大白猪的60K芯片数据,将数据整合后通过多种软件进行群体遗传结构分析、选择信号分析和ROH检测,并对相关位点和区域进行了基因定位与富集分析.结果显示:隆林猪近交程度最低但可能已经受西方商业猪种血液入侵,血统不纯;陆川猪近交程度最高,且与东山猪在遗传距离和亲缘关系上都比较近;去除隆林猪后,共有435个位点受到了选择,以50 kb作为受选择区域共定位到了175个基因,参与了31条信号通路,其中分别有5、9、7、9、1个基因与脂肪、糖尿病或胰岛功能、免疫、繁殖、热应激相关;广西地方猪种共检测到4491个ROH区域,高频ROH区域主要位于1、4、7、14号染色体,共定位到了48个基因,参与8条信号通路,其中4、3、2个基因分别与免疫、繁殖和肉质相关,4号染色体还存在一个区域被7个品种同时定位,包含的DECR1基因可能与广西地方猪种的独特肉质性状有关.本研究结论为广西地方品种中有DECR1、TNNC1和MTCH2等基因与肉质相关;IL12A、BCL11B和TLR9等基因与免疫功能相关;GNRHR、RBBP4和ALAS1等基因与繁殖性状相关;该结论为广西地方猪种种质资源开发、利用提供了重要理论依据.

分类号：

  • 相关文献
作者其他论文 更多>>