数字农科院2.0

基于转录组测序的巴马香猪和杜洛克猪骨骼肌差异lncRNA分析

文献类型： 中文期刊

作者： 胡梦灵;范新浩;姚一龙;闫超;谢炳坤;兰干球;梁晶;唐中林

作者机构：

关键词： （1-1-3）巴马香猪;杜洛克猪;背最长肌;转录组测序;lncRNA

期刊名称：南方农业学报

ISSN： 2095-1191

年卷期： 2024 年 55 卷 3 期

页码：

收录情况： 北大核心（2023版） ; ; CSCD（2023-2024年度） ; ; 科技核心（2024版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： 【目的】通过对巴马香猪和杜洛克猪背最长肌组织进行转录组测序鉴定差异表达lncRNA,筛选与骨骼肌发育形成相关的候选基因,为明确lncRNA对骨骼肌生长发育的调控机制提供理论基础。【方法】采集12月龄的巴马香猪和杜洛克猪背最长肌组织进行转录组测序,以错误发现率(FDR)1为标准筛选差异表达基因(DEGs)和差异表达lncRNA,并进行实时荧光定量PCR验证,预测差异表达lncRNA靶基因并进行GO功能注释和KEGG信号通路富集分析,选取表达差异最大的lncRNA构建其与靶基因互作网络。【结果】在巴马香猪和杜洛克猪背肌间共鉴定出6316个DEGs和675个差异表达lncRNA；GO功能注释分析结果表明,差异表达lncRNA靶基因主要涉及代谢过程、肌肉组织发育及骨骼肌细胞增殖和分化等生物过程；KEGG信号通路富集分析结果表明,差异表达lncRNA靶基因在Hippo和Wnt信号通路显著富集(P

分类号：

  • 相关文献

[1]北京黑猪与杜洛克猪肌内脂肪沉积相关基因的筛选. 白云华,王立贤,陈华林,麻柱,杨超,路永强,王楚端,黄全奎,邢凯,王朝军,薛振华. 2024

[2]利用配对RNA-seq数据筛选显著差异背膘厚度松辽黑猪背最长肌差异表达基因. 侍玉梅,马骏,赵延辉,原佳妮,沈奥,曹永春,盛熙晖,邢凯,白立景,翟丽维,王楚端. 2022

[3]北美猪的育种体系. 王立贤,程笃学. 2005

[4]杜洛克猪饲料利用效率性状的遗传参数估计及其相关性分析. 蒲蕾,张龙超,王立刚,施辉毕,王立贤. 2015

[5]杜洛克猪HMGA1基因多态位点与生长、饲料利用性状的关联分析. 蒲蕾,刘欣,岳静伟,张金山,王立刚,颜华,侯欣华,高红梅,张恬,张跃博,武群清,张龙超,王立贤. 2016

[6]杜洛克猪MAP3K5基因多态位点与生长、饲料利用性状的关联分析. 蒲蕾,岳静伟,张金山,刘欣,王立刚,颜华,侯欣华,高红梅,张恬. 2016

[7]杜洛克猪饲料利用效率测定阶段及RFI校正公式研究. 张金山,王立刚,张跃博,张龙超,王立贤. 2019

[8]杜洛克猪HLCS基因多态位点与生长发育性状的相关性分析. 蒲蕾,代宇星,张跃博,张龙超,郭亮,王立贤. 2020

[9]甜高粱和玉米青贮对肉羊肌纤维组织及其 相关肉质性状的影响. 王婷,侯明杰,尚占环,王虎成. 2018

[10]日粮维生素A水平对肉牛肝脏和肌肉维生素A和E含量的影响. 张丽萍,王加启,雒秋江,张幸开,万发春. 2005

[11]育成期日粮营养对育肥皖南牛背最长肌部位肉常规营养物质含量的影响. 张兴隆,杨永在,王长水,曹兵海. 2015

[12]欧拉型藏羊肉理化及近红外光谱特性研究. 王振宇,王培培,陈丽,饶伟丽,张德权. 2012

[13]深度测序鉴定绵羊microRNA转录组. 张世芳,魏彩虹,陆健,张小宁,周鑫磊,张淑珍,王光凯,曹家雪,赵福平,张莉,杜立新. 2013

[14]腌制时间对牦牛臂肌四头肌和背最长肌食用品质的影响. 王莉,张丽,孙宝忠,周玉春,黄彩霞,王春晓,刘璇. 2014

[15]青海高原牦牛PRDM16基因克隆、生物信息学及组织差异表达分析. 赵生军,张勇,郭宪. 2016

[16]长途运输应激对西门塔尔牛不同部位肉品质指标的影响. 雷元华,杨媛丽,张松山,李素霞,谢鹏. 2018

[17]腌制时间对牦牛臂肌四头肌和背最长肌食用品质的影响. 王莉,张丽,孙宝忠,周玉春,黄彩霞,王春晓,刘璇. 2013

[18]育成期营养水平对育肥皖南牛背最长肌不同部位肉品质的影响. 张兴隆,杨永在,王长水,曹兵海. 2014

[19]基于转录组分析挖掘平凉红牛背最长肌肉质性状候选基因. 王文翔,杜丽丽,张路培,高雪,徐凌洋,李俊雅,高会江. 2023

[20]华西牛与雪龙黑牛背最长肌重量的全基因组关联分析. 杜悦莹,安炳星,邓天宇,杜丽丽,梁忙,李柯安宁,曹晟,高会江,闵令江. 2024

作者其他论文 更多>>