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一种基因编辑位点特异性PCR方法的开发和应用

文献类型： 中文期刊

作者： 张洪文;赵圣博;闫晓红;李俊;翟杉杉;肖芳;高鸿飞;李允静;吴刚;武玉花

作者机构：

关键词： 基因组编辑作物;基因编辑位点特异性PCR;身份鉴定;定量检测

期刊名称：中国油料作物学报

ISSN： 1007-9084

年卷期： 2021 年 43 卷 1 期

页码：

收录情况： CSCD（2020-2021年度） ; 农林核心（2020版） ; 科技核心（2020版）

摘要： 为了对基因组编辑产品进行精准定性和定量检测,以水稻SP1基因的编辑植株为材料,在编辑位点上下游设计通用引物,在编辑位点处设计基因编辑位点特异性TaqMan探针,建立了编辑位点特异性PCR方法。利用该方法可准确鉴定特异基因组编辑产品,检测灵敏度达到5～10拷贝,可在实时荧光PCR(qPCR)和微滴数字PCR(ddPCR)平台上对基因组编辑产品进行定量检测。由于数字PCR的微反应单元可消除野生型DNA对通用引物的竞争性消耗,与qPCR的定量结果相比,ddPCR定量结果具有更高的定量准确性。

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