基于CRISPR/Cas9技术的全基因组基因编辑MDCK细胞文库的构建
文献类型: 中文期刊
作者: 朱媛媛;许榜丰;闫鸣昊;刘芹防;滕巧泱;苑纯秀;李雪松;李泽君
作者机构:
关键词: CRISPR/Cas9;MDCK细胞系;全基因组;基因编辑
期刊名称:中国动物传染病学报
ISSN: 1674-6422
年卷期: 2022 年
页码:
收录情况: 北大核心(2020版) ; 科技核心(2021版) ; 农林核心(2020版)
摘要: 本研究利用CRISPR/Cas9基因编辑技术,首先靶向犬全基因组设计合成转录sgRNA的DNA文库,并将DNA文库全部克隆于lentiCRISPR V2慢病毒转移载体上,高通量测序结果显示文库覆盖度高、均一性良好。将质粒文库和慢病毒包装系统质粒共转染293T细胞,收取含慢病毒样病毒的上清感染MDCK细胞,在最适嘌呤霉素筛选下,收集嘌呤霉素抗性细胞,冻存于-80℃,提取一部分细胞的基因组,通过PCR扩增转录sgRNA的DNA,将PCR产物插入到T载体后,挑取单克隆菌落,测序表明细胞文库中转录的sgRNA具有较好的覆盖度。本实验成功构建了犬全基因组范围转录sgRNA的质粒文库,并成功构建了MDCK细胞全基因组范围的基因编辑细胞库,该文库可作为后续筛选病毒复制关键宿主因子的细胞平台。
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