文献类型： 中文期刊
作者： 郭锦志;马士杰;韩先干;付立霞
作者机构：
关键词： 鮰爱德华菌;密度感应系统;LuxI/LuxR;基因克隆;生物信息学
期刊名称： 安徽农业科学
ISSN： 0517-6611
年卷期： 2023 年 18 期
页码：
收录情况： 不在遴选数据库范围（2023版）
摘要： 克隆鮰爱德华菌(Edwardsiella ictaluri)YCH株酰基高丝氨酸内酯(Acyl homoserine lactones,AHLs)合成酶(LuxI)和AHLs受体蛋白(LuxR)的全长基因,并对其进行生物信息学分析.序列分析结果显示,LuxI全长666 bp,共编码221个氨基酸;LuxR全长720 bp,编码239个氨基酸.构建LuxI/LuxR的系统发生树,结果显示,鮰爱德华菌LuxI/LuxR与迟缓爱德华菌(Edwardsiella tarda)、杀鱼爱德华菌(Edwardsiella piscicida)、保科爱德华菌(Edwardsiella hoshinae)等有较近亲缘关系.利用SWISS-Model软件,分别以1K4J.1.A(46.15％)和5l09.1.A(40.83％)蛋白作为模板对LuxI蛋白的8-189区域和LuxR蛋白2个功能结构域Pfam:Autoind_bind(9～151氨基酸)和HTH_LUXR(171～228氨基酸)进行分子模拟,其中LuxI结构域内有明显的"V"形疏水腔结构,LuxR的N-端结构域有α-β-α排列,C-端结构域内有螺旋—转角—螺旋结构.
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