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红麻基因组WRKY家族成员的鉴定及其在镉胁迫下的表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 李辉;陈安国;唐慧娟;栾明宝

作者机构：

关键词： 红麻;镉胁迫;WRKY基因家族

期刊名称：农业生物技术学报

ISSN： 1674-7968

年卷期： 2024 年 32 卷 10 期

页码：

收录情况： 北大核心（2023版） ; ; CSCD（2023-2024年度） ; ; 科技核心（2024版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： 重金属镉污染农田的修复是世界性的难题。红麻(Hibiscus cannabinus)耐逆性强，可用于镉污染农田的修复。为了探索红麻WRKY家族成员对镉胁迫的响应模式，本研究利用HMMER和BLAST软件在红麻基因组中鉴定获得HcWRKY家族成员，并通过ExPasy在线网站获得了HcWRKY家族成员的分子信息，同时利用TBtools v1.6软件将家族成员全部定位到相应染色体上。结果表明，33个HcWRKY家族成员不均匀地分布在12条染色体上，其理化性质，如氨基酸数量、蛋白质分子量和理论等电点各不相同。除HcWRKY4-2位于细胞质外，其他HcWRKY成员均定位于细胞核内。系统发育分析表明，33个HcWRKY蛋白分为4组：其中第Ⅱ组和第Ⅳ组仅含HcWRKY家族成员；第Ⅰ组和Ⅲ组同时含有HcWRKY和AtWRKY家族成员。实时荧光定量PCR分析表明，受镉胁迫诱导表达的HcWRKY家族成员有24个。在红麻响应镉胁迫反应过程中22个HcWRKY家族成员基因表达量上调，2个HcWRKY家族成员基因表达量下调。这可能是红麻耐镉能力强的一个重要因素。本研究结果为进一步探索HcWRKY基因家族在红麻响应镉胁迫过程中的生物学功能提供了基础资料。

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