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全基因组重测序解析不同牦牛类群的系谱及遗传结构

文献类型： 中文期刊

作者： 王佟;马晓明;余道宁;马超凡;潘和平;梁春年;扎西塔;阎萍

作者机构：

关键词： 全基因组重测序;祁连牦牛;系谱;遗传资源;遗传结构

期刊名称：中国草食动物科学

ISSN： 2095-3887

年卷期： 2023 年 43 卷 06 期

页码：

收录情况： 农林核心（2020版）

摘要： 为了解不同牦牛类群的系谱及遗传结构，选择九龙牦牛、天祝白牦牛、斯布牦牛、帕米尔牦牛、木里牦牛、雪多牦牛、祁连牦牛和肃南牦牛为研究对象，进行全基因组重测序。根据基因型数据进行主成分分析、系统发育树、杂合度和连续纯合子片段分析等解析遗传结构。结果表明，8个牦牛群体间均表现出较高的分化程度；8个牦牛群体的理论杂合度在0.354 4～0.360 0之间，其中肃南牦牛的观测杂合度最大，木里牦牛的观测杂合度最小；8个牦牛群体的近交系数在0.022 9～0.136 0之间；帕米尔牦牛群体中检测到的ROH（连续纯合子区域）数量最大，肃南牦牛最少。综上，8个牦牛群体之间没有过多的基因交流，其中祁连牦牛是在长时间的进化发育过程中产生的一个单独的类群。

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