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帕米尔牦牛FGF10基因克隆及组织表达

文献类型: 中文期刊

作者: 邓婧瑛;陈倩;王佟;于沁冉;张明昊;马超凡;李宁;包鹏甲;阎萍;贾建磊

作者机构:

关键词: 帕米尔牦牛;FGF10基因;基因克隆;组织表达

期刊名称:中国草食动物科学

ISSN: 2095-3887

年卷期: 2025 年

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收录情况: 北大核心(2023版) ; ; 农林核心(2024版)

摘要: 本研究旨在探究牦牛FGF10基因的结构和功能,并分析其在帕米尔牦牛8个组织中的表达规律。以帕米尔牦牛肌肉组织cDNA为模板并采用PCR技术克隆FGF10基因的CDS区,通过生物信息学方法对该基因序列进行分析,结合qRT-PCR对帕米尔牦牛8个不同组织样本的FGF10基因表达水平进行定量检测。结果表明,帕米尔牦牛FGF10基因的编码序列(CDS区)长度为642 bp,共编码213个氨基酸。同源性对比结果表明,帕米尔牦牛与野牦牛和家牛的相似性最高,为100%;与小家鼠的相似性最低,为90.1%。生物信息学分析结果显示,帕米尔牦牛FGF10蛋白的分子式为C1049H1639N299O307S13,原子总数、不稳定指数和总平均亲水指数分别为3 307、45.07和-0.358,表明该蛋白为稳定性亲水蛋白。信号肽分析证明FGF10蛋白属于分泌型蛋白,且含跨膜螺旋结构,经亚细胞定位分析发现,该蛋白主要分布在胞外环境中。其分子结构中包含2个N糖基化位点,同时存在47个潜在磷酸化位点;此外,FGF10 蛋白的二级结构以无规则卷曲为主要构成形式,与FGFR1、FGFR2和FLT1等蛋白存在互作关系。FGF10基因在8个组织的表达规律分析表明组织间存在差异,其中,肌肉组织相对表达量最高(P<0.01)。

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