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帕米尔牦牛PPP1R11基因克隆、生物信息学及组织表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 邓婧瑛;于沁冉;王佟;李宁;贾建磊;包鹏甲;阎萍

作者机构：

关键词： 帕米尔牦牛;PPP1R11基因;基因克隆;组织表达

期刊名称：华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2025 年 40 卷 06 期

页码：

收录情况： 北大核心（2023版） ; ; CSCD（2025-2026年度） ; ; 科技核心（2024版） ; ; 农林核心（2024版）

摘要： 为研究牦牛PPP1R11基因的结构和功能，及在8个不同组织中的表达规律，以帕米尔牦牛睾丸组织cDNA为模板，使用PCR技术克隆帕米尔牦牛PPP1R11基因CDS区序列，并进行生物信息学分析，PPP1R11基因在帕米尔牦牛8个组织中的表达水平通过实时荧光定量PCR （RT-qPCR）进行测定。结果表明，帕米尔牦牛PPP1R11基因CDS区全长324 bp,编码107个氨基酸。同源性对比结果显示，帕米尔牦牛与野牦牛的相似性最高（100%）,与小家鼠的相似性最低（84.6%）。生物信息学分析结果表明，PPP1R11蛋白分子式为C503H803N163O164S8,原子总数为1 641,不稳定指数和总平均亲水指数分别为65.91和-1.385,为亲水性蛋白；PPP1R11蛋白不具有信号肽和跨膜结构，主要定位在细胞核中；且该蛋白有1个糖基化位点和19处潜在的磷酸化位点；蛋白的二级结构以无规则卷曲为主，与PPP1R7、PPP1CA和NSFL1C等蛋白存在主要相互作用。RT-qPCR分析表明，PPP1R11基因在帕米尔牦牛心脏、肌肉、脂肪、脾脏、肝脏、胰脏、肾脏和睾丸这8个组织中存在差异性表达，相较于其他7种组织，PPP1R11在睾丸中的表达显著上调。

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