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牦牛MYL7基因克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 马荣;洛桑顿珠;平措占堆;卓玛次仁;尼玛加措;成述儒;梁春年

作者机构：

关键词： 桑桑牦牛;MYL7基因;基因克隆;生物信息学分析

期刊名称：中国草食动物科学

ISSN： 2095-3887

年卷期： 2024 年

页码：

收录情况： 北大核心（2023版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： 克隆西藏桑桑牦牛肌球蛋白轻链7(Myosin light chain 7，MYL7)基因CDS区，进行生物信息学分析并检测该基因在各组织中的表达差异，为探究该基因功能提供一定的理论依据。以桑桑牦牛肌肉组织cDNA为模板，利用PCR技术克隆其CDS区序列，并利用多种在线生物软件及工具进行生物信息学分析。结果表明，桑桑牦牛MYL7基因CDS区长447 bp，共编码148个氨基酸，该基因编码的蛋白分子式为C743H1155N187O237S7，原子数为2 329，理论等电点为4.37，不稳定系数和总平均亲水性分别为36.02和﹣0.364，属于稳定亲水性蛋白；具有特异性的磷酸化位点有11个，其中丝氨酸有5个、苏氨酸有5个以及1个酪氨酸。MYL7蛋白无信号肽和跨膜螺旋结构，属于非分泌性蛋白。通过亚细胞定位发现，桑桑牦牛MYL7基因在线粒体、细胞核、细胞质、细胞膜等中均有所分布。蛋白高级结构主要是α-螺旋和无规则卷曲。通过构建系统进化树发现，桑桑牦牛与野牦牛亲缘关系最近，符合实际情况，说明MYL7基因在进化过程中相对具有一定的保守性。

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