数字农科院2.0

梅花鹿基因组微卫星分布特征研究

文献类型： 中文期刊

作者： 卢凯妹;王天骄;董世武;邢秀梅;苏伟林

作者机构：

关键词： 梅花鹿;基因组;微卫星;分布特征

期刊名称：特产研究

ISSN： 1001-4721

年卷期： 2022 年

页码：

收录情况： 科技核心（2021版） ; 农林核心（2020版）

摘要： 为深入研究梅花鹿基因组中微卫星结构和特征，开发梅花鹿专用微卫星标记，本研究利用课题组前期测序、拼接和组装得到的梅花鹿基因组序列，搜索并分析了微卫星分布特征。结果显示，在梅花鹿基因组中1～6 bp碱基微卫星有354 766个，总长度为7 696 656 bp，相对密度为3 229.89 bp/Mb，约占基因组总长度的0.31%。不同类型微卫星拷贝数量占比和大小分别为二碱基（80.33%）＞三碱基（9.86%）＞五碱基（4.25%）＞四碱基（3.64%）＞单碱基（1.58%）＞六碱基（0.32%）。1～6 bp不同碱基类型微卫星的优势类别分别为A、 TG、AGC、AAAT、ACTGA和TTCACT。将微卫星定位到了33条染色体上，分布频率最高的是X染色体，其次是30号染色体，最低的是7号染色体，梅花鹿33条染色体序列长度与所含微卫星数量呈正相关（r=0.99，P＜0.000 1）。梅花鹿基因组中1～6 bp碱基微卫星数量丰富，能够筛选出足够的微卫星标记，用于梅花鹿亲子鉴定、个体识别技术。

分类号：

  • 相关文献

[1]假眼小绿叶蝉微卫星位点的生物信息学分析. 李倩,陈学新,韩宝瑜. 2016

[2]Chromosome-level genome of a multivoltine biotype Ostrinia furnacalis strain. Liu, Kaiqiang,Zhang, Tiantao,Zhang, Yongjun,Wang, Zhenying,He, Kanglai. 2025

[3]黑龙江地区农田害鼠发生特点及DNA条形码鉴定技术的应用. 李争光,丛林,王大伟,罗婵,田林,耿远昭,宋英,马晓慧,李宁,刘晓辉. 2018

[4]黄河流域棉区纤维品质区域分布特征与生态区划研究. 唐淑荣,王延琴,付小琼,韦京艳,杨伟华,魏守军,周治国. 2017

[5]三唑磷在水稻籽粒中动态变化及分布特征. 应兴华,徐霞,欧阳由男,朱智伟,陈铭学,朱敏. 2010

[6]山东植烟土壤与烤烟微量元素分布特点及相关分析. 王影影,梁洪波,王勇,李哲,彭东,于利,刘海伟,闫慧峰,徐宜民. 2014

[7]三峡库区次级河流富营养化水体中有机锡污染的分布特征. 高俊敏,张科,郭劲松,金芬,周彬,魏云梅. 2014

[8]茶树体内硫的分布特征及施硫对茶叶产量和品质影响研究. 潘建义,洪苏婷,张友炯,朱跃进,廖万有,韩文炎. 2016

[9]紫穗槐植株的养分含量及分布特征. 刘雪云,周志宇,郭霞,王瑞,梁坤伦. 2012

[10]基于ACRM辐射传输模型的植被叶面积指数遥感反演. 姜志伟,陈仲新,任建强. 2010

[11]鱼腥草内生微生物的分布特征初探. 胡汝晓,李珊,谭周进,赵武能,谢丙炎,谢达平,肖冰梅,伍参荣. 2008

[12]灌溉水质对土壤碱解氮分布特征的影响. 李朝阳,杨玉辉,王兴鹏. 2017

[13]香稻品种2-乙酰-1-吡咯啉多样性及籽粒分布特征的研究. 应兴华,徐霞,欧阳由男,朱智伟,施建华. 2011

[14]四个品种烟草内生微生物的分布特征. 杨友才,谭周进,张德咏,谢丙炎,刘勇. 2009

[15]青海果洛地区不同鼠洞密度下高寒草甸植物生物量分布特征. 孙飞达,龙瑞军,蒋文兰,路承香. 2008

[16]赣南纽荷尔脐橙叶片微量元素含量状况. 凌丽俐,彭良志,淳长品,曹立,江才伦. 2010

[17]退化沙质草地植物群落物种多样性与土壤肥力的关系. 文海燕,傅华,赵哈林. 2008

[18]山东典型植烟土壤微量元素有效态含量研究. 王影影,梁洪波,徐宜民,董建新,王程栋. 2014

[19]西藏日喀则地区栽培牧草中7种微量元素的分布特征. 王楠,李晓忠,秦彧,田发益,姜文清,周志宇. 2010

[20]鲁中烟区典型植烟土壤腐殖质空间分布特征初步研究. 宛祥,董建新,李军,梁洪波,徐宜民,李德成,吴元华,王海云,王影影,周月梅,张东,王正旭. 2013

作者其他论文 更多>>