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大麦黄矮病毒PAV河南分离物通读蛋白ORF5基因的分子特征分析

文献类型： 中文期刊

作者： 刘艳;王锡锋;李志忠

作者机构：

关键词： 大麦黄矮病毒;通读蛋白;系统进化分析;多样性

期刊名称：河南农业大学学报

ISSN： 1000-2340

年卷期： 2010 年 44 卷 05 期

页码： 74-79

收录情况： 北大核心

摘要： 利用RT-PCR从河南各地采集的110份小麦病样上鉴定出28个大麦黄矮病毒(Barley yellow dwarf viruse,BYDV)PAV分离物,并获得了这28个分离物的通读蛋白(Read through protein,RTP)ORF5基因全长.通过氨基酸序列比对可知,河南分离物RTP-ORF5基因变异普遍较大,28个BYDV-PAV河南分离物RTP-ORF5基因之间的核苷酸序列一致性为75.9%~100%,氨基酸序列一致性为79.4%~99.8%,核苷酸和氨基酸的一致性变异都较大.与国内外报道的16个BYDV-PAV通读蛋白基因相比对,其核苷酸序列一致性为72.2%~99%,由此推导的氨基酸序列一致性为77%~99.6%.系统进化分析显示河南地区分离物在4个内组群中都有分布.这些数据说明河南的大麦黄矮病毒PAV多样性丰富.

分类号： S435.123

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