文献类型： 中文期刊
作者： 王富强;张建;温常龙;樊秀彩;张颖;孙磊;刘崇怀;姜建福
作者机构：
关键词： 葡萄;KASP标记;品种鉴定;指纹图谱;遗传多样性分析
期刊名称：中国农业科学
ISSN： 0578-1752
年卷期： 2021 年 54.0 卷 13.0 期
页码：
收录情况： 北大核心（2020版） ; CSCD（2020-2021年度） ; 农林核心（2020版） ; 科技核心（2020版）
摘要： 【目的】开发一组能够区分中国主栽葡萄品种的竞争性等位基因特异性PCR（KASP）分子标记,为中国葡萄品种保护、品种登记和市场维权等提供技术支撑。【方法】基于前人筛选的60个葡萄高多态性SNP位点,转化为KASP标记。分别使用23份代表性品种和76份主要栽培品种对转化成功的KASP标记进行初筛、复筛、验证,获得一组高质量的KASP标记,并用于构建76份葡萄品种的DNA指纹图谱。【结果】60个SNP位点有3个不具备基因组特异性,6个无法设计KASP-PCR引物,最终51个SNP成功转化为KASP标记,转化率达到89.47%。利用LGC-SNPline平台对23份代表性品种进行基因分型,51个KASP标记全部成功分型。基于次要等位基因频率（MAF）大于0.25、多态性信息含量（PIC）大于0.35、缺失率小于0.2、杂合率小于0.6等参数,初步筛选出27个优质KASP标记。使用构建指纹图谱的76份品种复筛出22个高质量KASP标记。22个KASP标记的缺失率均小于0.12,PIC均大于0.3,杂合率在0.4—0.6的标记占77.27%,MAF大于0.3的标记占95.45%。此外,利用这22个标记对同一品种不同树体提取的23份代表性品种的DNA扩增检测,前后两次检测分型结果稳定一致,表明这22个标记具有较好的重复性和稳定性。进一步将基于22个标记获得的76份葡萄品种分型结果转化为二元编码数据,得到76份葡萄品种的指纹图谱。经邻接聚类分析和群体结果分析,可将76份葡萄品种分为3类,并能正确区分二倍体和多倍体。仅用10个标记（VIT1518567587、VIT64258638、VIT83320936、VIT1222228357、VIT1119390306、VIT1617950801、VIT1811138668、VIT12739916、VIT1613454358、VIT1621202286）就能区分70份品种,其中有54份品种达到品种鉴定的标准（差异位点数≥2）。【结论】从60个葡萄SNP中成功转化51个KASP标记,并筛选出22个高质量KASP标记,构建了76份葡萄品种的SNP指纹图谱,首次验证了KASP技术在我国葡萄品种鉴定中的可行性。
分类号：
- 相关文献
[1]适于甘蓝型油菜品种鉴定的核心KASP标记开发及其应用. 洪美艳,高界,袁荣,任雪贞,景琦,罗莉霞,郭瑞星,曾新华. 2025
[2]葡萄品种SSR分子鉴定体系的建立及应用. 王富强,李贝贝,樊秀彩,张颖,刘崇怀,姜建福. 2020
[3]基于KASP标记的芥菜种质资源分子身份证构建. 朱海峰,王天鹏,全瀚仪,陈海旭,蔡旭,梁建丽,武剑,李梅兰,王晓武. 2025
[4]利用SRAP引物组合构建甜菜品种的指纹图谱. 闫彩燕,邹奕,马龙彪,邳植,王茂芊,兴旺,吴则东. 2019
[5]利用ISSR构建甜菜品种指纹图谱. 齐少玮,闫彩燕,郭佳,吴则东,兴旺. 2019
[6]利用SSR构建甜菜品种的分子身份证. 栗媛,王茂芊,邳植,吴则东. 2019
[7]AFLP分子标记技术在名贵春兰鉴别中的应用. 陈惠云,孙志栋,孙日飞,王晓武,葛红. 2007
[8]国产糖甜菜品种SSR指纹图谱的构建. 吴则东,马龙彪,胡珅,王茂芊,王华忠. 2013
[9]利用SSR标记鉴定柚和杂柑品种. 雷天刚,何永睿,吴鑫,刘小丰,许兰珍,彭爱红,陈善春. 2007
[10]11个德国甜菜品种指纹图谱的构建. 吴则东,王华忠,马龙彪,王茂芊. 2013
[11]棉花品种指纹图谱构建及棉种鉴定技术研究. 王俊芳,杨伟华,匡猛,许红霞,王延琴,周大云,冯新爱. 2009
[12]AFLP分子标记技术在名贵春兰鉴别中的应用. 陈惠云,孙志栋,孙日飞,王晓武,葛红. 2007
[13]中国50个甘蓝代表品种EST-SSR指纹图谱的构建. 王庆彪,张扬勇,庄木,杨丽梅,刘玉梅,吕红豪,方智远. 2014
[14]基于SSR标记的MCID法鉴定中国自主选育的葡萄品种. 魏新科,樊秀彩,王晨,刘崇怀. 2019
[15]利用基于RAPD标记的MCID法快速鉴定72个葡萄品种. 王玉娟,张彦,房经贵,刘崇怀,宋长年,孙欣. 2012
[16]葡萄种类和品种鉴定技术研究进展. 王姣,刘崇怀,樊秀彩,孙海生. 2008
[17]葡萄品种分子鉴定研究进展及展望. 李贝贝,刘崇怀,姜建福,张颖,樊秀彩,张国海. 2017
[18]291个葡萄品种SSR分子指纹数据集. 武亚敬,冀晓昊,于祎飞,时梦,王孝娣,王宝亮,刘凤之,李明亮,王贺,刘俊,王海波. 2025
[19]104个小麦品种抗条锈性及遗传多样性分析. 王明玉,冀凯燕,冯晶,蔺瑞明,王凤涛,徐世昌. 2018
[20]基于SSR标记的76份紫心甘薯品种的遗传多样性分析. 高闰飞,李强,苏在兴,后猛,唐维,杨强强,刘旋旋,闫会,王欣,刘亚菊,张允刚,马代夫. 2020
作者其他论文 更多>>
-
高温对葡萄的影响及应对措施
作者：姜建福;王荣;马闯;王超霞;田淑芬
关键词：葡萄;高温;气候变暖;应对措施
-
不同抗性葡萄响应白腐病侵染的次生代谢物变化
作者：谭西北;兰徐颖;刘崇怀;樊秀彩;姜建福;孙磊;李鹏;余书鑫;张颖
关键词：葡萄;白腐病;抗病;代谢组学;次生代谢物
-
TLR7/8激动剂R848对梅花鹿Y精子分选效率的影响
作者：张旭林;唐毓;刘理想;范冰峰;张燠诗;张颖;邵静;孙慧敏;褚萧宇;彭飞宇;许保增
关键词：梅花鹿;R848;PVP;Y精子分离
-
129份葡萄属(Vitis L.)种质资源枝条抗寒性鉴定评价
作者：吴文桐;马潇乐乐;王星;林美苓;徐志鹏;刘崇怀;郭印山;姜建福
关键词：葡萄属;抗寒性;评价;低温半致死温度;差热分析
-
水体活化技术工艺包治理河道黑臭水体氮磷效果
作者：王骏;;张颖;;严海蒗;;申锋;;刘芳;;王强;;黄治平
关键词：水体活化技术工艺包;;黑臭水体;;水体自洁装置;;高效磷吸附剂;;氮磷去除效果
-
甘氨酸提高水貂卵母细胞玻璃化冷冻保存效率的关键机制
作者：唐毓;张颖;杨镒峰;薛海龙;刘理想;许保增
关键词：玻璃化冷冻;水貂卵母细胞;甘氨酸;体积调控
-
基于深度学习的鲜食葡萄叶片品种识别研究
作者：潘博文;林美苓;鞠延仑;苏宝峰;孙磊;樊秀彩;张颖;张永辉;刘崇怀;姜建福;房玉林
关键词：鲜食葡萄;深度学习;品种识别;叶片