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金定鸭FABP1基因克隆、生物信息学及表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 韦文静;屈玉玲;权金强;袁浩楠;于海波;李昌文;夏长友;高彩霞;赵生国

作者机构：

关键词： 金定鸭;FABP1基因;生物信息学分析;系统进化;表达

期刊名称：甘肃农业大学学报

ISSN： 1003-4315

年卷期： 2025 年

页码：

收录情况： 北大核心（2023版） ; ; CSCD（2025-2026年度） ; ; 科技核心（2024版） ; ; 农林核心（2024版）

摘要： 【目的】明确肝脏型脂肪酸结合蛋白（FABP1）基因的分子特征，为解析FABP1基因在金定鸭脂肪沉积性状中的调节机制提供理论依据。【方法】采集金定鸭的心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、卵巢、腹脂及脑等组织样品提取总RNA，扩增FABP1基因编码区（CDS）序列并进行生物信息学分析。同时，检测FABP1基因在金定鸭各组织中的表达情况。【结果】FABP1基因CDS序列全长为384 bp，共编码127个氨基酸，其编码蛋白二、三级结构主要由无规卷曲、延伸链和α-螺旋三种结构构成，无信号肽和跨膜结构，属于携带负电荷的亲水性稳定蛋白；FABP1氨基酸序列同源比对及系统发育进化分析结果均显示，金定鸭与绿头鸭亲缘关系最近，其次是凤头潜鸭，与家鼠、人、牛的亲缘关系最远；FABP1基因在肝脏中表达量最高，极显著高于其他组织（P＜0.01），在肺脏、脾脏、脑、心脏、卵巢中表达量较低；PPI互作网络显示该蛋白与脂肪酸结合蛋白4/5/6/7（FABP4/5/6/7）、过氧化物酶体增殖物激活受体γ（PPARG）、过氧化物酶体增殖物激活受体ɑ（PPARA）、载脂蛋白B（APOB）等蛋白间存在互作关系。【结论】FABP1基因在金定鸭的各组织中均有表达，且在涉及甘油三酯和脂肪酸合成代谢的相关组织（肝脏、脂肪）中特异性高表达，可能对脂肪的合成与代谢过程起重要的调控作用。

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