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基于转录组测序筛选肉鸡腹水综合征相关候选基因

文献类型： 中文期刊

作者： 苏蒙;刘莎;宋丹丽;高倩梅;郑麦青;文杰;赵桂苹;李庆贺

作者机构：

关键词： 肉鸡;腹水综合征;转录组;差异表达基因

期刊名称：畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2024 年

页码：

收录情况： 北大核心（2023版） ; ; CSCD（2023-2024年度） ; ; 科技核心（2024版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： 旨在从心脏和肺脏组织中筛选介导肉鸡腹水综合征发生的关键候选基因与通路。本研究以33日龄快速型白羽肉鸡父系为素材，选取患腹水征公鸡5只，正常公鸡3只，通过剖检与血液生化指标测定确定腹水征公鸡发病情况，分为腹水组与正常组，腹水组5只公鸡，正常组3只公鸡。对腹水组与正常组进行血液生化指标测定与比较分析，解剖取左心室心肌组织制作HE切片，取心、肺组织样品进行转录组测序。血液生化结果显示腹水组红细胞压积（HCT）、血红蛋白（HGB）和粒细胞百分比（GRA）非常显著高于正常组（P＜0.01）。腹水组淋巴细胞百分比（LYM）非常显著低于正常组（P＜0.01）。腹水组二氧化碳分压（PCO2）、总钙（Ca）含量非常显著高于正常组（P＜0.01），腹水组剩余碱（Beb）含量显著低于正常组（P＜0.05）。HE切片结果显示，正常组心肌组织肌原纤维排列整齐，细胞间未见血细胞沉积；腹水组心肌细胞中肌原纤维结构紊乱，大量血细胞沉积在肌原纤维之间。转录组分析筛选到肺脏组织差异表达基因969个，包括417个上调基因和552个下调基因，心脏组织差异表达基因809个，包括397个上调基因和412个下调基因。通路富集显著富集到了细胞周期（mitotic cell cycle）、着丝粒复合物组装（centromere complex assembly）、氧气结合（oxygen binding）、神经活性配体-受体相互作用（neuroactive ligand-receptor interaction）、细胞黏附分子（cell adhesion molecules）、细胞衰老（cellular senescence）、细胞外基质-受体相互作用（ECM-receptor interaction），运动蛋白（motor proteins）。从富集通路中筛选与肉鸡腹水综合征相关的基因进行实时荧光定量PCR验证，结果KIF20A、NUSAP1、HBAD、TFRC、HBBA基因在腹水组和正常组间差异表达趋势与转录组测序结果一致，可作为肉鸡腹水综合征重要候选基因。本研究利用转录组技术筛选到与肉鸡腹水综合征的发生相关的重要通路和候选基因，对研究肉鸡腹水综合征的发病机制和预防具有十分重要的意义。

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