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森林草莓糖基转移酶基因家族生物信息学及其表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 赵倩倩;宋艳红;宋盼;陈亚铎;李刚;赵霞;刘丽锋;周厚成

作者机构：

关键词： 森林草莓; 糖基转移酶基因(UGT)家族; 基因结构; 基因功能; 表达分析

期刊名称：南方农业学报

ISSN： 2095-1191

年卷期： 2021 年 52.0 卷 6.0 期

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; CSCD（2020-2021年度） ; 农林核心（2020版） ; 科技核心（2020版）

摘要： 【目的】对森林草莓糖基转移酶基因(FvUGT)家族进行生物信息学分析及基因表达分析,为深入研究森林草莓UGT基因功能和探索UGT调控草莓果实发育及花色苷及品质形成提供理论依据。【方法】基于Phytozome数据库鉴定得出138个FvUGT基因家族基因,运用生物信息学方法分析其蛋白理化性质、基因结构、保守结构域和进化关系,并采用实时荧光定量PCR对UFGT候选基因在森林草莓(红果和白果2个类型)各组织(根、叶柄、叶和果实)中的表达量进行分析。【结果】FvUGT基因家族可分为12个类群(A、C、D、E、F、G、H、I、J、K、L和N),每个类群分别包含16、2、23、32、8、1、5、5、7、3、21和4个成员；染色体定位发现FvUGT基因家族成员在除2号染色体之外的其他染色体上均有分布,且分布不均；FvUGT基因内含子长度、外显子位置和数目在不同成员间均存在差异,FvUGT基因家族在进化过程中产生较强的分化。实时荧光定量PCR检测结果表明,FvUFGT70基因在森林草莓白果和红果的叶和叶柄中有较高表达；FvUFGT94基因在各组织中均有表达；FvUFGT67和FvUFGT68基因在根中有较高表达；而FvUFGT95和FvUFGT96基因在果实中有表达,且显著高于其他组织(P

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