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基因组选择信号揭示西×荷杂交牛杂种优势相关基因

文献类型： 中文期刊

作者： 范婷婷;马毅;王兢;赵国耀;徐凌洋;陈燕;张路培;高会江;李俊雅;高雪

作者机构：

关键词： 全基因组;选择信号;杂种优势

期刊名称：中国畜禽种业

ISSN： 1673-4556

年卷期： 2023 年 19 卷 7 期

页码：

收录情况： 不在遴选数据库范围（2023版）

摘要： 为探究德系西门塔尔牛与荷斯坦牛的杂种优势,挖掘与杂种优势相关的候选基因,解析牛杂种优势的遗传机制。该研究选择系谱信息清晰的德系西门塔尔牛(父本)、荷斯坦牛(母本)及其杂交F_(1)代共91头个体,利用Illumina Bovine GGP100K高密度芯片进行基因分型,基于群体分化系数Fst对其开展研究,鉴定杂种优势相关基因。结果表明,F_(1)代与德系西门塔尔牛(父本)Fst分析发现,在全基因组水平Top 1%的阈值内,检测到859个SNPs位点区域Fst值>0.19,注释到候选基因249个；与荷斯坦牛(母本)的Fst分析,发现有860个SNPs位点区域Fst值>0.15,注释到261个候选基因。基因Pathway富集分析发现,F_(1)代与父本间受到选择的基因主要富集在轴突引导通路(P

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