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苹果PME家族全基因组鉴定及果实发育表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 李晓晶;闫震;杨玲

作者机构：

关键词： 苹果;果胶甲酯酶;基因家族;生物信息学分析;果实发育

期刊名称：果树学报

ISSN： 1009-9980

年卷期： 2025 年

页码：

收录情况： 北大核心（2023版） ; ; CSCD（2025-2026年度） ; ; 科技核心（2024版） ; ; 农林核心（2024版）

摘要： 【目的】对苹果PME基因家族进行鉴定和系统的生物信息学分析，并分析其在苹果果实不同发育阶段的表达模式，为后续PME基因的研究奠定基础。【方法】以拟南芥PME蛋白序列为参考，在苹果全基因组数据库（GDDH13 v 1.1）中查询苹果PME基因家族成员，通过TBtools等软件对该基因家族进行生物信息学分析，结合转录组和qRT-PCR分析该基因家族在苹果果实不同发育时期的表达模式。【结果】鉴定到82个PME基因家族成员，分布于15条染色体上，编码156～731个氨基酸，多为亲水性蛋白，定位于细胞壁上。系统进化树将MdPMEs分为4个亚族。全基因组重复是MdPMEs基因家族扩张的主要原因。MdPMEs基因启动子区存在大量与生长发育、激素信号传导和逆境胁迫响应相关的顺式作用元件。16个MdPMEs基因在苹果果肉中表达，筛选出6个关键候选基因参与果实发育过程。【结论】鉴定到82个PME基因家族成员，MdPME40、MdPME46和MdPME79在果实发育阶段持续高表达，MdPME13/15和MdPME42分别在成熟和贮藏期特异性上调。

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