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全基因组关联分析揭示白羽肉鸡孵化性状的遗传基础

文献类型： 中文期刊

作者： 张高猛;丁纪强;刘昱宏;郑麦青;文杰;赵桂苹;李庆贺

作者机构：

关键词： 白羽肉鸡;受精率;孵化率;全基因组关联分析;转录组测序

期刊名称：畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2022 年

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; ; CSCD（2021-2022年度） ; ; 科技核心（2021版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： 旨在揭示白羽肉鸡孵化性状的遗传基础。本试验以白羽肉鸡A、B两个公鸡群体为素材，测定A群体5个世代（556只）、B群体3个世代（398只）的40周龄种蛋受精率和孵化率，并利用55K SNP芯片对两个群体共954个健康个体进行基因分型。基于系谱和基因型信息计算的A群体的受精率遗传力分别为0.21和0.14。利用混合线性模型对受精率和孵化率进行全基因组关联分析（genome-wide association study，GWAS）。全基因组关联分析共关联到12个显著SNPs，分布在1、9、11、12、20、号染色体上，其中有9个SNPs与受精率显著关联，有3个SNPs与孵化率显著关联，对A群体受精率高低组各4只公鸡睾丸组织进行转录组测序，实时荧光定量PCR验证两个差异表达基因。全基因组关联分析筛选出9个与受精率相关的候选基因COPG1、ADAMTS18、FABP2、CDH8、SLCO4A1、ATP13A3、NELL2、VEZT和IGHMBP2；3个与孵化率相关的候选基因TMEM、SCO1和MYH1A。转录组测序与荧光定量PCR验证了两个与受精率相关的候选基因HMGCLL1和COA6。本研究利用GWAS和转录组测序筛选到孵化性状的相关候选基因，为白羽肉鸡孵化性状的遗传改良提供了重要的分子标记。

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