普通烟草HSP20基因家族成员鉴定及表达分析
文献类型: 中文期刊
作者: 赵泽玉;杜甫;李子玮;王琰琰;王荣浩;施友志;孙晋浩;田震;赵清海;管恩森;孙刚;王大海;王朔;李志远
作者机构:
关键词: 烟草;NtHSP20;进化分析;抗逆胁迫;表达分析
期刊名称:中国烟草学报
ISSN: 1004-5708
年卷期: 2024 年
页码:
收录情况: 北大核心(2023版) ; ; CSCD(2023-2024年度) ; ; 科技核心(2024版) ; ; 农林核心(2020版)
摘要: 【背景和目的】热休克蛋白20(Heat Shock Protein 20, HSP20)是一个重要的蛋白质家族,在植物生长发育及抗逆胁迫中发挥重要作用,目前HSP20基因在烟草中还未有广泛的研究。【方法】通过茄科数据库,利用生物信息学分析手段,确定普通烟草中HSP20家族成员并进行相关分析。【结果】在烟草中鉴定得到了58个HSP20家族基因,进化分析将其划分为13个亚家族,分布在13条染色体上;共线性分析表明烟草中有5对基因存在染色体片段复制;顺式作用元件分析表明NtHSP20成员上游存在生长发育、胁迫响应等多种顺式作用元件;HSP20家族基因具有显著的组织特异表达性,在根、茎中基因表达数量和表达水平较明显,在花中的表达数量和表达水平较低;qRT-PCR分析表明NtHSP20家族部分成员对干旱胁迫具有特异性响应,且在不同的胁迫阶段不同基因表达量有显著差异。【结论】该研究为后续烟草HSP20家族生长发育和抗逆胁迫等机理研究奠定了基础。
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