数字农科院2.0

普通烟草HSP20基因家族成员鉴定及表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 赵泽玉;杜甫;李子玮;王琰琰;王荣浩;施友志;孙晋浩;田震;赵清海;管恩森;孙刚;王大海;王朔;李志远

作者机构:

关键词: 烟草;NtHSP20;进化分析;抗逆胁迫;表达分析

期刊名称:中国烟草学报

ISSN: 1004-5708

年卷期: 2024 年

页码:

收录情况: 北大核心(2023版) ; ; CSCD(2023-2024年度) ; ; 科技核心(2024版) ; ; 农林核心(2020版)

摘要: 【背景和目的】热休克蛋白20(Heat Shock Protein 20, HSP20)是一个重要的蛋白质家族,在植物生长发育及抗逆胁迫中发挥重要作用,目前HSP20基因在烟草中还未有广泛的研究。【方法】通过茄科数据库,利用生物信息学分析手段,确定普通烟草中HSP20家族成员并进行相关分析。【结果】在烟草中鉴定得到了58个HSP20家族基因,进化分析将其划分为13个亚家族,分布在13条染色体上;共线性分析表明烟草中有5对基因存在染色体片段复制;顺式作用元件分析表明NtHSP20成员上游存在生长发育、胁迫响应等多种顺式作用元件;HSP20家族基因具有显著的组织特异表达性,在根、茎中基因表达数量和表达水平较明显,在花中的表达数量和表达水平较低;qRT-PCR分析表明NtHSP20家族部分成员对干旱胁迫具有特异性响应,且在不同的胁迫阶段不同基因表达量有显著差异。【结论】该研究为后续烟草HSP20家族生长发育和抗逆胁迫等机理研究奠定了基础。

分类号:

  • 相关文献

[1]烟草SAUR基因家族鉴定及表达分析. 吴孟婷,籍燕,周东新,刘国祥,燕思凡,李媛,宁扬,林天然,李洋洋,张兴伟,程崖芝. 2024

[2]拟南芥抗病基因RPP8转化烟草及其表达分析. 杨玉婷,陈武,李颖,黄三文,黎定军. 2009

[3]烟草苯丙烷代谢途径关键酶肉桂酸-4-羟化酶、4-香豆酸-辅酶A基因的分离及表达特性分析. 于利,张彦,陈爱国,梁洪波,Qamaruddin Jogi,徐文玲,许娜. 2014

[4]烟草NtGH3基因家族鉴定及其应答青枯菌侵染的表达分析. 徐沛雯,余文,程崖芝,巫升鑫,牛文利,李冰洁,王李先秋,丁安明,王卫锋. 2023

[5]烟草转录因子NtNAC080在非生物胁迫下的表达分析及功能鉴定. 文利超,熊涛,邓智超,刘涛,郭存,李伟,郭永峰. 2023

[6]烟草OSCA基因家族鉴定及非生物胁迫诱导表达模式分析. 邓智超,田冬冬,宋青松,郭存,文利超,王奇,初雨蒙,刘涛,郭永峰. 2022

[7]烟草SHMT基因家族鉴定与非生物胁迫诱导表达分析. 李童,邓智超,刘涛,薛瑾,李伟,郭永峰. 2024

[8]MYB转录因子在植物抗逆胁迫中的作用及其分子机理. 刘蕾,杜海,唐晓凤,吴燕民,黄玉碧,唐益雄. 2008

[9]磷脂酶D在植物逆境信号转导中的作用机制研究进展. 孙磊,钟秀丽. 2012

[10]“兰箭3号”春箭筈豌豆叶绿体全基因组草图及特征分析. 陶晓丽,马利超,聂斌,王彦荣,刘志鹏. 2017

[11]雷蒙德氏棉SWEET基因家族的全基因组鉴定和进化分析. 陈慧敏,李威,马雄风,裴小雨,刘艳改,贺昆仑,张飞,张文生,王振玉,杨代刚,胡守林. 2017

[12]兰花磷酸肌醇特异性磷脂酶C基因家族生物信息学分析. 胡广隆,陈亚娟,魏建华,王宏芝,张杰伟. 2017

[13]毛果杨CBF/DREB1基因家族生物信息学分析. 丁咚,陈亚娟,崔进荣,魏建华,张玉红,张杰伟. 2018

[14]桃磷酸肌醇特异性磷脂酶C基因家族鉴定与分析. 张杰伟,任飞,张中保,谢华,魏建华. 2017

[15]兰花eIF5A基因家族鉴定与生物信息学分析. 张杰伟,汤久杨,陈兰芬,王宁琳,王宏芝,魏建华. 2017

[16]我国牛副流感病毒3型山东分离株的研究. 朱远茂,蔡红,董秀梅,吕闯,史鸿飞,严昊,马磊,王姝,王雪枝,薛飞. 2013

[17]一株H5N2亚型流感病毒的全基因组序列分析及致病性的研究. 李文辉,关立峥,张芳,王晶,卢昆鹏,施建忠,邓国华,陈化兰. 2014

[18]芸薹属AC基因组中SUC基因家族的鉴定与进化分析. 袁午舟,周荣芳,童超波,程晓晖,黄军艳,于景印,董彩华,刘胜毅. 2014

[19]鸭肠炎病毒UL41、UL42基因的克隆与分析. 陈普成,柳金雄,曾青华,姜永萍,田国彬,陈化兰. 2009

[20]H3N2亚型猪流感病毒进化分析及重组HA1蛋白间接ELISA诊断方法的建立. 丁选亚,乔传玲,杨焕良,陈艳,辛晓光,韩庆功,陈化兰. 2007

作者其他论文 更多>>