鲁道夫对盲囊线虫C新种的ITSrDNA序列测定及种系发育关系分析
文献类型: 中文期刊
作者: 张媛;林瑞庆;赵光辉;袁子国;宋慧群;朱兴全
作者机构:
关键词: 鲁道夫对盲囊线虫C种;内转录间隔区;rDNA;种系发育关系分析
期刊名称:中国兽医科学
ISSN:
年卷期: 2009 年 04 期
页码: 298-302
收录情况: CSCD
摘要: 以鲁道夫对盲囊线虫C种为研究对象,对其rDNA的内转录间隔区(ITS)序列进行PCR扩增、测序和序列分析,以ClustalⅩ1.81程序对序列进行比对,然后用MEGA4.0程序的MP法和NJ法及PUZ-ZLE4.1程序的ML法构建鲁道夫对盲囊线虫A、B、C种以及北方对盲囊线虫的种系发育关系。结果显示,鲁道夫对盲囊线虫C种的ITS-1,5.8S,ITS-2序列大小分别为451bp、127bp和277bp,鲁道夫对盲囊线虫3个种与北方对盲囊线虫ITS序列种内差异小,种间差异明显。种系发育关系分析发现,这3种方法(NJ法、MP法和ML法)构建的种系发育树的拓扑结构基本一致,其中C种和A种聚在...
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