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玉蜀黍属植物叶绿体基因组进化及变异研究

文献类型： 中文期刊

作者： 马闯;贾民隆;王杰;彭丹;邢国芳;武志强

作者机构：

关键词： （1-1-2）叶绿体基因组;玉蜀黍属;进化;系统发育

期刊名称：东北农业大学学报

ISSN： 1005-9369

年卷期： 2024 年 5 期

页码：

收录情况： 北大核心（2023版） ; ; CSCD（2023-2024年度） ; ; 科技核心（2024版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： 玉蜀黍属(Zea)又名玉米属,包含玉蜀黍(俗称玉米,Z.mays)及其野生种,是全球重要谷物之一,也是基础研究的模式植物.为深入解析该属物种系统发育关系和遗传变异规律,研究利用NCBI已发表的201个玉蜀黍属植物Illumina二代测序数据,通过组装、注释和分析,全面探究玉蜀黍属植物叶绿体基因组.结果表明,玉蜀黍属叶绿体基因组呈典型的环状四分体结构,全长为140 443～141 050 bp,GC含量为38.4%,共有128个基因被注释;密码子偏好性分析发现,玉米与其他物种差异明显,尤其对UUA密码子偏好性最明显;玉米与其他物种重复序列总体上无明显差异,但在简单重复序列类型中,玉米与其他物种区别较大;所有样本在系统发育分析中被分为四组,共鉴定出79个单倍型,同一组样本聚集,主成分分析结果支持不同组的样本可清晰分开;核苷酸多态性分析准确定位了10个高变位点,可作为潜在的DNA条形码.综上,研究揭示了201个玉蜀黍属植物叶绿体基因组之间的遗传变异和系统进化关系,为加速玉米育种进程提供了细胞器遗传基因组的新视角.

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