基于高精度转录组测序技术挖掘甘蔗抗梢腐病相关的NBS-LRR家族基因
文献类型: 中文期刊
作者: 曾子颜;张木清;张兴坦
作者机构:
关键词: 甘蔗;转录组;梢腐病;NBS-LRR
期刊名称:基因组学与应用生物学
ISSN: 1674-568X
年卷期: 2022 年
页码:
收录情况: 北大核心(2020版) ; CSCD(2021-2022年度) ; 科技核心(2021版)
摘要: 甘蔗(Saccharum officinarum L.)是中国乃至世界第一大糖料作物,也是非常重要的生物能源作物。甘蔗在大田生长过程中经常遭遇病原菌侵入而诱发甘蔗病害,严重时会造成产量下降、品质受损,在广西蔗区常年大面积种植甘蔗,梢腐病的发生极为普遍,也常因此造成严重的经济损失。本研究以具有易感梢腐病特征的现代栽培种甘蔗-中蔗1号为实验材料,结合一种更高精度的转录组测序新技术,在全基因组水平鉴定到含有NB-ARC结构域的NBS抗病基因(含等位基因)共2,324个,其中在中蔗1号梢腐病病株与健康蔗株中存在差异表达的基因有101个。进一步对这些基因的结构域进行注释分析,确定了36个NBS-LRR类抗病基因。推测这些基因可能参与甘蔗对梢腐病致病菌的抵御以及甘蔗侵染病害后的一系列防御反应。
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