数字农科院2.0

牦牛“海绵吸附”bta-miR-146a的lncRNA筛选及靶向验证

文献类型： 中文期刊

作者： 王运路;孟朝轶;姚一龙;郭敏;牛家强;索朗斯珠;徐业芬

作者机构：

关键词： 牦牛;海绵吸附;lncRNA;bta-miR-146a

期刊名称：中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2023 年 03 期

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; ; CSCD（2023-2024年度） ; ; 科技核心（2023版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： 【目的】筛选牦牛卵泡发育过程中可能对靶向Smad家族成员4（Smad family member 4,Smad4）基因的bta-miR-146a具有“海绵吸附”作用的长链非编码RNA（long non-coding RNA,lncRNA）。【方法】使用miRanda和RNAhybrid数据库对靶向牦牛bta-miR-146a的lncRNA进行预测;采集牦牛卵巢,分离健康、闭锁卵泡,用Trizol法提取RNA并反转录为cDNA,利用PCR检测所预测lncRNA的表达情况;利用实时荧光定量PCR法检测所筛选lncRNA和bta-miR-146a/Smad4在牦牛健康、闭锁卵泡中的表达情况;构建lncRNA-ENSBGRT00000000387.1的野生型和突变型双荧光素酶载体,将其与bta-miR-146a-mimics、mimics NC共转染至HEK293T细胞,检测双荧光素酶活性。【结果】试验共筛选出7个可能对靶向Smad4基因的bta-miR-146a具有“海绵吸附”作用的lncRNAs,其中的lncRNA-ENSBGRT00000000387.1在牦牛卵泡中表达量极显著高于其他lncRNAs（P＜0.01）。实时荧光定量PCR检测发现,lncRNA-ENSBGRT00000000387.1、bta-miR-146a和Smad4基因mRNA在牦牛健康和闭锁卵泡中共表达,且lncRNA-ENSBGRT00000000387.1和Smad4基因mRNA在牦牛健康卵泡中的表达量均显著高于闭锁卵泡（P＜0.05）,bta-miR-146a在牦牛健康卵泡中的表达量极显著低于闭锁卵泡（P＜0.01）。试验成功构建牦牛lncRNA-ENSBGRT00000000387.1野生型及突变型pmirGLO双荧光素酶报告质粒,双荧光素酶活性结果显示,bta-miR-146a mimics对牦牛lncRNA-ENSBGRT00000000387.1-WT具有极显著下调作用（P＜0.01）。【结论】lncRNA-ENSBGRT00000000387.1、bta-miR-146a和Smad4基因mRNA可能在牦牛卵泡发育或闭锁过程中存在调控机制,并在体外初步证实lncRNA-ENSBGRT00000000387.1与bta-miR-146a具有“海绵吸附”作用,这为进一步研究lncRNA-ENSBGRT00000000387.1在牦牛卵泡中的功能机制提供依据。

分类号：

  • 相关文献

[1]lncRNA-MSTRG.7889.1竞争性结合bta-miR-146a靶向Smad4调控牦牛颗粒细胞的凋亡. 孟朝轶,王运路,姚一龙,席广银,牛家强,索朗斯珠,郭敏,徐业芬. 2024

[2]牦牛“海绵吸附”bta-miR-125b的lncRNA筛选验证及慢病毒载体构建. 贺鸿世,姚一龙,索朗斯珠,孟朝轶,孔庆辉,席广银,郭敏,徐业芬. 2024

[3]动物繁殖相关lncRNA的研究新进展. 贺小云,狄冉,胡文萍,王翔宇,刘秋月,储明星. 2016

[4]哺乳动物毛囊发育及调控研究进展. 郭雪峰,包鹏甲,常永芳,张永峰,李忠邦,雷蕾,阎萍,潘和平. 2019

[5]肌肉发育相关 LncRNA 的研究进展. 魏彩虹,吴明明,刘瑞凿,赵福平,张莉,杜立新. 2014

[6]LncRNA9606对猪流行性腹泻病毒复制的影响. 燕苗苗,陈佳宁,刘光亮. 2020

[7]鸡lncRNA-MSTRG.15568.9及其预测靶基因的表达. 黄子妍,孙研研,李云雷,许红,刘一帆,石雷,叶建华,麻慧,倪爱心,王攀林,谢金防,陈继兰. 2019

[8]牛体内囊胚全转录组模式解析. 王晶晶,张培培,郝海生,杜卫华,庞云渭,权国波,赵善江,邹惠影,朱化彬,赵学明. 2020

[9]LncRNA9606 对猪流行性腹泻病毒复制的影响. . 2020

[10]LncRNA在哺乳动物毛囊发育调控中的研究进展. 常永芳,包鹏甲,褚敏,吴晓云,梁春年,阎萍. 2019

[11]肌肉发育相关LncRNA的研究进展. 魏彩虹,吴明明,刘瑞凿,赵福平,张莉,杜立新. 2014

[12]小麦lncRNA27195及其靶基因TaRTS克隆及表达分析. 王娜,白建芳,马有志,郭昊宇,王永波,陈兆波,赵昌平,张立平. 2021

[13]长链非编码RNA在畜禽脂代谢中的作用研究进展. 孙嘉宏,谭晓冬,杨欣婷,赵桂苹,文杰,刘冉冉. 2021

[14]非洲猪瘟病毒感染后猪外周血淋巴细胞Toll样受体信号通路的lncRNA-mRNA分析. 陈世钰,崔帅,蒋亚君,鑫婷,王洋,郝玉欣,黄建新,郭晓宇,朱鸿飞,吴佳俊,贾红. 2022

[15]植物lncRNA及其对低温胁迫响应的研究进展. 陈晓,于茗兰,吴隆坤,郑晓明,逄洪波. 2023

[16]基于转录组测序的巴马香猪和杜洛克猪骨骼肌差异lncRNA分析. 胡梦灵,范新浩,姚一龙,闫超,谢炳坤,兰干球,梁晶,唐中林. 2024

[17]玉米苗期抗旱lncRNA基因的挖掘. 冯新雨,刘旭洋,唐怀君,何冠华,李永祥,李春辉,刘成,王天宇,黎裕,路运才,张登峰. 2025

[18]Mechanisms And Functions Of Long Non-Coding Rnas At Multiple Regulatory Levels. Shen, Fafu,Zhu, Weidong,Yin, Zujun,Cheng, Yingying,Zhang, Xiaopei,Wang, Wei,Dong, Jie. 2019

[19]Discovery of novel long non-coding RNAs induced by subgroup J avian leukosis virus infection in chicken. Qiu, Lingling,Li, Zhiteng,Chang, Guobin,Bi, Yulin,Xu, Lu,Zhang, Yang,Zhao, Wenming,Xu, Qi,Chen, Guohong,Liu, Xiangping.

[20]LncPheDB: a genome-wide lncRNAs regulated phenotypes database in plants. Lou D.,Li F.,Ge J.,Fan W.,Liu Z.,Wang Y.,Huang J.,Xing M.,Guo W.,Wang S.,Qiao W.,Han Z.,Qian Q.,Yang Q.,Zheng X.. 2022

作者其他论文 更多>>