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茄子全基因组InDel变异特征及分子标记开发和应用

文献类型： 中文期刊

作者： 尤园园;王帅;方莹莹;齐诚;李淑培;张映;陈钰辉;刘伟;刘富中;舒金帅

作者机构：

关键词： 茄子;InDel标记;遗传多样性;指纹图谱;F1代真实性鉴定

期刊名称：园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2023 年

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; ; CSCD（2023-2024年度） ; ; 科技核心（2023版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： 选取4份圆茄（Solanum melongena L.）高代自交系进行全基因组重测序，鉴定出145 407个InDel，12号染色体InDel数最少（7 752），1号最多（19 738）。筛选出7 959个长度大于10 bp的InDel位点，挑选均匀分布在基因组上的144个设计InDel引物并进行验证。利用26份茄子材料对144对InDel引物进行筛选，63对表现出稳定的多态性，比例为43.75%；主要等位基因频率为0.4038 ～ 0.9808，平均为0.7659；基因多样性指数(Hs)为0.0377 ～ 0.6501，平均为0.3217；多态性信息含量（PIC）为0.0370 ～ 0.5750，平均为0.2663，42个标记多态性信息含量大于0.200，多态性较好。当遗传距离为0.235时，将26份不同类型茄子材料划分为2个类群。利用多态性信息含量高的前10个InDel标记构建了26份茄子材料DNA指纹图谱。另外，选择在亲本间具有多态性的InDel标记用于4个杂交组合的F1代真实性鉴定，鉴定结果表明3个为真实杂交种，与田间鉴定结果吻合。

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