数字农科院2.0

茄子全基因组InDel变异特征及分子标记开发和应用

文献类型： 中文期刊

作者： 尤园园;王帅;方莹莹;齐诚;李淑培;张映;陈钰辉;刘伟;刘富中;舒金帅

作者机构：

关键词： 茄子;InDel标记;遗传多样性;指纹图谱;F1代真实性鉴定

期刊名称：园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2023 年

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; ; CSCD（2023-2024年度） ; ; 科技核心（2023版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： 选取4份圆茄（Solanum melongena L.）高代自交系进行全基因组重测序，鉴定出145 407个InDel，12号染色体InDel数最少（7 752），1号最多（19 738）。筛选出7 959个长度大于10 bp的InDel位点，挑选均匀分布在基因组上的144个设计InDel引物并进行验证。利用26份茄子材料对144对InDel引物进行筛选，63对表现出稳定的多态性，比例为43.75%；主要等位基因频率为0.4038 ～ 0.9808，平均为0.7659；基因多样性指数(Hs)为0.0377 ～ 0.6501，平均为0.3217；多态性信息含量（PIC）为0.0370 ～ 0.5750，平均为0.2663，42个标记多态性信息含量大于0.200，多态性较好。当遗传距离为0.235时，将26份不同类型茄子材料划分为2个类群。利用多态性信息含量高的前10个InDel标记构建了26份茄子材料DNA指纹图谱。另外，选择在亲本间具有多态性的InDel标记用于4个杂交组合的F1代真实性鉴定，鉴定结果表明3个为真实杂交种，与田间鉴定结果吻合。

分类号：

  • 相关文献

[1]美洲南瓜全基因组InDel标记的开发与应用. 董佳美,杨永照,孙柳清,卢秋晨,陈宛露,武喆,段颖,雷逢进,王长林,薄凯亮. 2025

[2]无籽西瓜品种SSR指纹图谱构建及遗传多样性分析. 赵胜杰,朱红菊,路绪强,何楠,刘文革. 2013

[3]无籽西瓜品种SSR 指纹图谱构建及遗传多样性分析. 赵胜杰,朱红菊,路绪强,何楠,刘文革. 2013

[4]绥农14及其系谱亲本的遗传多样性及重组分析. 秦君,姜成喜,刘章雄,付亚书,关荣霞,陈维元,李英慧,张孟臣,景玉良,常汝镇,邱丽娟. 2006

[5]甘蔗属不同种及优良甘蔗栽培品种的SSR标记遗传多样性分析. 李杨瑞,方锋学,吴凯朝,游建华. 2010

[6]我国部分蓖麻品种遗传资源SSR分析及DNA指纹图谱. 薛建峰,谭美莲,严明芳,汪磊,傅春玲,王力军,严兴初. 2015

[7]我国茶树主要骨干亲本及其衍生品种(系)的SSR分析. 段云裳,姜燕华,王丽鸳,成浩,房婉萍,黎星辉. 2011

[8]花生分子标记的研究进展. 任小平,姜慧芳,廖伯寿,陈本银. 2006

[9]利用中国秋大豆(Glycine max(L.) Merr)筛选SSR核心位点的研究. 谢华,常汝镇,曹永生,张明辉,冯忠孚,邱丽娟. 2003

[10]油莎豆SRAP指纹图谱构建及遗传多样性分析. 赵永国,郭瑞星,罗丽霞. 2013

[11]基于EST-SSR标记的云南无性系茶树良种遗传多样性分析及指纹图谱构建. 孙雪梅,李友勇,黄安平,汪云刚,成浩,宋维希,陈林波,段志芬,马玲. 2012

[12]红麻种质资源SRAP指纹图谱构建及遗传多样性分析. 郑海燕,粟建光,戴志刚,李燕,陈基权,龚友才. 2011

[13]无籽西瓜品种SSR指纹图谱构建及遗传多样性分析. 赵胜杰,朱红菊,路绪强,何楠,刘文革. 2014

[14]中国黄瓜主栽品种SSR 遗传多样性分析及指纹图谱构建. 苗晗,张圣平,顾兴芳,王烨,陈磊. 2014

[15]中国不同省份籼稻地方品种的指纹图谱分析. 张媛媛,束爱萍,曹桂兰,韩龙植. 2010

[16]33份晒烟种质资源SSR标记的指纹图谱构建. 刘国祥,邹昆晏,任民,佟英,冯全福,杨爱国,戴培刚,徐宜民,张兴伟. 2017

[17]利用SSR标记构建我国亚麻品种DNA指纹图谱及遗传多样性分析. 潘根,张义,赵立宁,陈安国,李建军,黄思齐,唐慧娟,常丽,张翠萍,邓勇,李德芳. 2019

[18]中国黄瓜主栽品种SSR遗传多样性分析及指纹图谱构建. 苗晗,张圣平,顾兴芳,王烨,陈磊. 2014

[19]32个棉花主栽品种DNA指纹图谱构建及遗传多样性分析. 杨伟华,匡猛,许红霞,王延琴,周大云,冯新爱,苏畅. 2012

[20]利用中国秋大豆（Glycine max(L.)Merr)筛选SSR核心位点的研究. 谢华,常汝镇,曹永生,张明辉,冯忠孚,邱丽娟. 2003

作者其他论文 更多>>