葡萄TPS基因家族全基因组鉴定及VvTPS4在单萜形成中的功能验证
文献类型: 中文期刊
作者: 杨彩丽;李永洲;贺亮亮;宋银花;章鹏;刘肇先;李鹏慧;刘三军
作者机构:
关键词: 葡萄;TPS基因家族;表达分析;香气;代谢组学
期刊名称:中国农业科学
ISSN: 0578-1752
年卷期: 2025 年 58 卷 07 期
页码:
收录情况: 北大核心(2023版) ; ; CSCD(2025-2026年度) ; ; 科技核心(2024版) ; ; 农林核心(2024版)
摘要: 【目的】基于葡萄基因组信息,通过生物信息学手段对葡萄TPS基因家族成员进行鉴定及表达分析,为后续VvTPSs的生物学功能研究和葡萄育种提供科学依据。【方法】根据拟南芥AtTPS基因家族成员蛋白序列和TPS对应的隐尔马可夫文件PF01397和PF03936,对VvTPS基因家族进行鉴定。利用Expasy、TBtools、MEME、MEGA、MCScanX、SPOMA、WoLF PSORT和PlantCARE等工具分析家族成员的理化性质、系统进化树、染色体定位、基因结构、蛋白质二级结构、启动子顺式作用元件和预测亚细胞定位。运用qPCR分析基因家族成员在无香型(‘红地球’)和玫瑰香型(‘玫瑰香’)葡萄成熟果实中的表达情况,并通过番茄转基因功能验证,分析转基因番茄果实挥发性代谢组学,以明确VvTPS4在单萜生物合成方面的功能。【结果】鉴定获得65个VvTPS基因家族成员,编码蛋白的氨基酸数目为339—840,平均分子质量为64.13 kDa,理论等电点为4.93—7.65,大多数成员具有7个外显子结构。经系统进化树分析,将葡萄TPS家族划分为TPS-a、TPS-b、TPS-c、TPS-e/f和TPS-g亚家族。VvTPS成员多定位于叶绿体和细胞质,其中,定位于质体的成员有10个属于TPS-g亚家族。在启动子区域发现含有大量响应光照、温度、干旱、激素和防御相关的顺式作用元件。克隆到29个VvTPSs,绝大多数VvTPSs在玫瑰香型葡萄果实中的表达高于无香型葡萄果实。转基因结果表明,过表达VvTPS4能够增加番茄果实中挥发性单萜物质的积累,其中,芳樟醇是最显著上调的化合物,是野生型的20.73倍,其次是L-α-松油醇(14.55倍),风味特征分析表明,这两种物质具有花香味,是影响‘玫瑰香’香气的主要特征物质。【结论】从葡萄基因组中鉴定到65个VvTPSs,成员之间具有高度的保守性,且在不同香气类型的葡萄中表达模式不同。过表达VvTPS4能显著增加挥发性单萜物质的积累,可能与玫瑰香气形成密切相关。
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