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中生菌素生物合成基因zpsA的克隆及序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 李丽华;田云龙;蒋细良;王立群;吴永英;朱昌雄

作者机构：

关键词： 中生菌素肽合成酶;基因;克隆;序列分析

期刊名称：生物信息学

ISSN： 1672-5565

年卷期： 2006 年 4 卷 01 期

页码： 1-4

摘要： 利用PCR技术,首次从淡紫灰链霉菌海南变种(Streptomyces lavendulaevar.hainanensis)的基因组克隆出了中生菌素生物合成基因簇中的负责β-赖氨酸活化的zpsA基因。根据国外已报道的诺尔丝菌素肽合成酶基因(npsA)和链丝菌素肽合成酶基因(sttA)的保守序列以及链霉菌基因密码子的偏爱性,设计简并引物;以中生菌素高产菌株UV-69的总DNA作为模板进行PCR,先后得到长度分别为0.284kb、0.611kb、0.34kb和0.37kb的PCR产物,经测序后拼接得到1.025kb的zpsA基因片段。在GenBank中的进行比对分析,发现ZpsA与NpsA、SttA的功能相同,都具有非核糖体肽合成酶腺苷酸化域(A域)的功能。

分类号： Q78

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