数字农科院2.0

SNaPshot技术检测茶树SNP研究

文献类型： 中文期刊

作者： 张成才;谭礼强;王丽鸳;韦康;成浩

作者机构：

关键词： 茶树;SNPs;SNaPshot;遗传多样性;遗传图谱

期刊名称：茶叶科学

ISSN： 1000-369X

年卷期： 2014 年 02 期

页码： 74-81

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了提高茶树SNPs分型效率,促进SNPs在茶树遗传育种中的应用,研究了SNaPshot技术进行茶树SNPs分型的可行性。从实验室前期确证的SNPs中,选择10个作为目标SNPs;使用SNaPshot技术在不同的茶树品种中进行分型;然后,对分型结果进行比对和统计,以验证SNaPshot技术检测茶树SNPs的准确性、重复性以及在茶树遗传多样性分析等方面的可用性。结果发现,6个SNPs分型结果与测序结果一致,准确率为60%;目标SNPs在龙井43及其重复实验中的分型结果完全一致;6个SNPs的等位基因数都是2,期望杂合度(He)介于0.37~0.52,观测杂合度(Ho)介于0.32~0.74,多态性信息含量(PIC)介于0.36~0.50;结果表明,SNaPshot技术对茶树SNPs的分型准确性高、重复性好,可以用于茶树遗传多样性分析以及茶树遗传图谱构建等方面的研究。

分类号： S571.1

  • 相关文献

[1]茶树遗传图谱研究进展. 马建强,姚明哲,陈亮. 2010

[2]玉米分子图谱的构建和遗传多样性评价. 王天宇,黎裕. 2000

[3]分子标记技术在牧草种质资源研究中的应用. 李志勇,孙启忠,李鸿雁,王小丽,师文贵,戴军. 2010

[4]小麦SSR标记的发展及应用. 朱振东,贾继增. 2003

[5]蚕豆种质资源、抗病育种和QTL定位及抗逆性研究进展. 王海飞,宗绪晓. 2011

[6]A MLP architecture fusing RGB and CASSI for computational spectral imaging. Zeyu Cai,Ru Hong,Xun Lin,Jiming Yang,You Liang Ni,Zhen Liu,Chengqian Jin,Feipeng Da. 2024

[7]基于EST-SSR的64个茶树品种遗传多样性与群体结构分析. 杨军,王让剑,孔祥瑞,郑国华,苏峰. 2018

[8]基于叶绿体rbcL和trnH-psbA序列的湖南茶树资源遗传多样性与亲缘关系研究. 刘振,成杨,赵洋,杨培迪,杨阳. 2018

[9]利用ISSR标记分析福云(半)同胞系茶树品种(系)的遗传多样性和亲缘关系. 余继忠,杨亚军,黄海涛,陈亮,姚明哲. 2009

[10]云南大茶树遗传多样性的EST-SSR分析. 周萌,李友勇,孙雪梅,王家金,谢瑾,成浩,汪云刚,刘本英. 2013

[11]15个茶树品种遗传多样性的RAPD分析. 陈亮,杨亚军,虞富莲,高其康,陈大明. 1998

[12]基于EST-SSR的福建地区茶树资源遗传多样性和亲缘关系分析. 刘振,姚明哲,王新超,陈亮. 2009

[13]我国茶树无性系品种遗传多样性和亲缘关系的ISSR分析. 姚明哲,陈亮,王新超,赵丽萍,杨亚军. 2007

[14]广西茶树地方品种遗传多样性和遗传结构的EST-SSR分析. 周炎花,乔小燕,马春雷,乔婷婷,金基强,姚明哲,陈亮. 2011

[15]基于SSR标记的茶树新品种遗传多样性分析及指纹图谱构建. 章志芳,马建强. 2012

[16]川、渝地方茶树品种的遗传多样性和群体结构. 姚明哲,马春雷,金基强,马建强,陈亮. 2012

[17]浙江省茶树地方品种与选育品种遗传多样性和群体结构的EST-SSR分析. 乔婷婷,马春雷,周炎花,姚明哲,刘饶,陈亮. 2010

[18]利用ISSR和EST-SSR标记分析茶树遗传多样性的比较. 刘本英,孙雪梅,李友勇,唐一春,贺巍,汪云刚,王平盛. 2009

[19]基于EST-SSR标记的云南野生茶树遗传多样性分析. 周萌,李友勇,孙雪梅,王家金,谢瑾,成浩,汪云刚,刘本英. 2013

[20]利用EST-SSR标记研究适制绿茶与乌龙茶品种的遗传多样性与遗传结构. 吴晓梅,姚明哲,马春雷,王新超,陈亮. 2010

作者其他论文 更多>>