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桑树幼叶cDNA文库的构建及部分表达序列标签分析

文献类型： 中文期刊

作者： 方荣俊;戚金亮;扈冬青;赵卫国;汪伟;张林;刘利;潘刚;沈兴家;潘一乐;杨永华

作者机构：

关键词： 桑树;cDNA文库;RNA转录5′末端转换;表达序列标签

期刊名称：蚕业科学

ISSN： 0257-4799

年卷期： 2008 年 34 卷 04 期

页码： 6-11

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 基于为鉴定和克隆桑树功能基因提供基础信息的目的,采用RNA转录5′末端转换(SMART)法构建了桑树幼叶全长cDNA文库。该文库容量为1.02×106pfu/mL,重组率95%,符合构建基因文库的质量要求。从构建的桑树幼叶cDNA文库中随机挑取48个克隆进行表达序列标签(EST)测序,有效序列为32条,经UniGene数据库归并后为32条,UniGene比率为100%;与NCBI核酸数据库进行比对、查询和注释,在32条序列中有29条序列具有同源性,其中16条为全长序列,完整性比率为55.2%;初步发现具有已知功能基因的ESTs 6个,具有推测功能基因的ESTs 5个,未命名或未知功能基因的ESTs 21个。

分类号： S888.2

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