天祝白牦牛GDF-10基因CDS区的多态性及生物信息学分析
文献类型: 中文期刊
作者: 李天科;梁春年;郎侠;裴杰;吴晓云;刘建;秦文;阎萍
作者机构:
关键词: 天祝白牦牛;GDF-10基因;多态性;生物信息学分析
期刊名称:生物技术通报
ISSN: 1002-5464
年卷期: 2013 年 11 期
页码: 79-85
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 采用DNA混合池测序法检测天祝白牦牛生长分化因子-10(Growth differentiation factor 10,GDF-10)基因编码区的多态性,应用生物信息学方法分析天祝白牦牛生长分化因子-10编码蛋白质特性。结果表明,天祝白牦牛生长分化因子-10基因编码区序列存在8个突变位点,其中90C→G、124C→G、1005G→A和1232G→C为错义突变,导致了编码氨基酸的改变,132T→C、822A→G、873G→T和888T→C为同义突变;天祝白牦牛生长分化因子-10编码蛋白质的氨基酸序列没有明显的疏水性区域和跨膜螺旋区;其存在信号肽,说明可能在细胞质中发挥生物学作用;天祝白牦牛生长分化因子-10编码产物二级结构是以α-螺旋和β-折叠为主;氨基酸序列与普通牛的同源性为99.4%,与人、小鼠、大鼠4个物种间同源性较高。
分类号: S823.85
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