少孢节丛孢菌新疆分离株丝氨酸蛋白酶全长基因的克隆及生物信息学分析
文献类型: 中文期刊
作者: 王俊伟;孟庆玲;乔军;王为升;罗建勋;才学鹏;赵春光
作者机构:
关键词: 少孢节丛孢菌;丝氨酸蛋白酶;基因克隆;生物信息学
期刊名称:石河子大学学报(自然科学版)
ISSN: 1007-7383
年卷期: 2011 年 29 卷 06 期
页码: 46-51
摘要: 根据已经报道的少孢节丛孢菌丝氨酸蛋白酶基因序列,设计特异性引物,通过PCR技术对少孢节丛孢菌新疆分离株(XJ-XA)丝氨酸蛋白酶(命名为Aoz1)基因序列进行了扩增,并与国内外少孢节丛孢菌不同地域分离株相应序列进行了同源性分析,构建该基因系统进化树。结果显示,XJ-XA Aoz1基因全长为1344bp,包含2个外显子和1个63bp的内含子(第517~579位核苷酸),编码426个氨基酸。Aoz1的信号肽位于氨基酸序列的第1~21位氨基酸;氨基酸序列的第160~171位、200~210位和351~361位分别是天冬氨酸(D)、组氨酸(H)和丝氨酸(S)活性位点所在区域,表明该酶属于Subtilase家族;该酶还含有2个潜在的N末端糖基化位点及2个与底物结合的S1区。系统发生分析发现,少孢节丛孢菌不同地域分离株Aoz1基因序列具有较高的亲缘性,与其他捕食线虫性真菌Aoz1基因亲缘性较远。本研究为研发家畜线虫病生物防控制剂奠定了前期基础。
分类号: S476.1
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