数字农科院2.0

大豆GmCOL1和GmCOL13启动子和基因组基因的克隆与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 韩英英;陈福禄;傅永福;张晓玫

作者机构：

关键词： 大豆;Gm COL1;Gm COL13;基因克隆;生物信息学分析

期刊名称：生物技术通报

ISSN： 1002-5464

年卷期： 2017 年 33 卷 8 期

页码： 63-72

收录情况： 北大核心（2020版） ; CSCD（2020-2021年度） ; 农林核心（2020版） ; 科技核心（2020版）

摘要： 以大豆天隆1号为材料提取基因组DNA,分别克隆到长2 631 bp的Gm COL1启动子和2 809 bp的Gm COL13启动子。此外,还克隆到Gm COL1和Gm COL13基因组基因长度分别为3 488 bp和2 798 bp,它们分别编码含348个和366个氨基酸的蛋白质。利用Plant CARE分析Gm COL1和Gm COL13的启动子序列发现,它们均含有以下调控元件:生物钟元件(Circadian)、光响应元件(ACEG-box等)、ABA响应元件(ABRE)、干旱诱导元件(MBS)、低温响应元件(LTR)。Prot Param分析表明,Gm COL1和Gm COL13蛋白质的分子量分别为38.47 k D和40.91 k D,并且都是亲水性蛋白。GOR分析显示,Gm COL1和Gm COL13的二级结构含有Alpha helix,Extended strand和Random coil。在线网站PROSITE的分析说明,Gm COL1和Gm COL13有两个Zinc finger B-box和一个CCT domain(CO,CO-LIKE and TOC1 domain)结构域。

分类号： Q943.2`S565.1

  • 相关文献

[1]苹果蠹蛾8个烟碱型乙酰胆碱受体基因的克隆与生物信息学分析. 郭金梦,罗嘉鹏,冯丽凯,李飞,林克剑,王桂荣. 2018

[2]甘蔗蔗糖转运蛋白SoSUT5基因克隆、表达及功能鉴定. 牛俊奇,苗小荣,王道波,杨丽涛,李杨瑞. 2018

[3]奶水牛固醇携带蛋白2基因克隆、生物信息学分析及其组织表达检测. 梁莎莎,庞春英,邓廷贤,马小娅,陆杏蓉,段安琴,梁贤威. 2018

[4]小偃麦异附加系TaXTH基因的克隆与生物信息学分析. 黄春丽,宋静,李全权,郭庆东,田秋菊,高居荣,王洪刚,封德顺. 2015

[5]家蚕微孢子虫丙酮酸激酶基因的克隆与表达特征分析. 张志林,齐静茹,尚瑞沙,陈红丽,张轶岭,沈中元. 2019

[6]球孢白僵菌HsbA蛋白家族类基因的克隆和生物信息学分析. 雷仲仁,王海鸿. 2011

[7]细粒棘球蚴RTN4基因的克隆及序列分析. 刘田莉,孟庆玲,乔军,陈诚,马玉,胡政香,才学鹏,陈创夫. 2016

[8]细粒棘球蚴TSP1和TSP6基因的克隆及生物信息学分析. 刘田莉,孟庆玲,乔军,陈诚,马玉,胡政香,才学鹏,陈创夫. 2015

[9]痘病毒F10L基因的克隆及生物信息学分析. 赵银龙,吴国华,吴健,朱海霞,颜新敏,赵志荀,李健,吴娜,张强. 2014

[10]马铃薯甲虫热激蛋白基因Ld-hsp90的克隆及温度胁迫下的表达. 李祥瑞,张云慧,郭文超,程登发,郭青云. 2013

[11]牛TRAF6基因编码区的克隆及序列分析. 王兴平,罗仍卓么,李峰,许尚忠,李俊雅,高雪. 2014

[12]甘薯果糖-1,6-二磷酸醛缩酶5基因(IbFBA5)的克隆与生物信息学分析. 苏在兴,李强,唐维,刘亚菊,后猛. 2015

[13]小桐子甲硫氨酸亚砜还原酶A的基因克隆及生物信息学分析. 王海波,邹竹荣,龚明. 2015

[14]小麦ent-柯巴基焦磷酸合酶基因TaCPS1的克隆与荧光定量分析. 郭庆东,李全权,田秋菊,钱艳丽,许田,杨艳林,王洪刚,封德顺. 2016

[15]香菇草酰乙酸水解酶基因LeOAH1克隆及表达分析. 段应策,胡姿仪,杨帆,李金涛,邬向丽,张瑞颖. 2020

[16]大麻FT同源基因CsHd3a的克隆及表达谱分析. 李铮,潘根,陶杰,黄思齐,唐慧娟,邓勇,赵立宁,李德芳. 2021

[17]海岛棉耐盐相关基因GbPLA1-32的克隆及生物信息学分析. 张红,张悦新,徐楠,芮存,范亚朋,王晶,韩明格,王琴琴,孙亮庆,陈修贵,陆许可,王俊娟,王德龙,王帅,郭丽雪,赵兰杰,陈超,陈全家,叶武威. 2022

[18]小麦矮腥黑粉菌g9890基因编码效应蛋白的生物信息学分析及亚细胞定位. 许停,刘太国,高利,陈万权. 2023

[19]小麦矮腥黑粉菌效应蛋白g10613的基因克隆与生物信息学分析. 郭志浩,高利,刘琦. 2023

[20]小麦矮腥黑粉菌g1070基因的克隆、生物信息学分析与亚细胞定位. 金泽鑫,刘琦,高利. 2023

作者其他论文 更多>>