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水牛甲状旁腺素基因克隆与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 梁莎莎;马小娅;邓廷贤;陆杏蓉;段安琴;朱鹏;梁贤威;庞春英

作者机构：

关键词： 水牛;甲状旁腺素;基因克隆;生物信息学

期刊名称：中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2017 年 9 期

页码： 2541-2548

摘要： 本研究参考黄牛甲状旁腺素(parathyroid hormone,PTH)基因序列设计引物,运用PCR扩增技术对水牛PTH基因进行克隆,并用生物信息学方法对序列进行分析。结果显示,成功克隆了水牛PTH基因完整编码区序列(CDS)348bp,可编码115个氨基酸。该基因编码区序列与黄牛、猪、马、山羊、绵羊和骆驼的同源性分别为99%、93%、91%、97%、96%和92%,表明PTH基因在不同物种间高度保守。系统进化树分析表明,水牛与黄牛PTH基因亲缘关系最近。此外,在水牛PTH基因CDS上共发现了3个碱基突变,其中两个属于同义突变,一个属于错义突变。氨基酸序列分析表明,该蛋白属于碱性、亲水、稳定型蛋白质,其分子式为C_(570)H_(941)N_(167)O_(164)S_8,分子质量为13.01ku。二级结构分析显示,水牛PTH蛋白以α-螺旋和无规则卷曲为主,与三级结构预测结果相一致。亚细胞定位分析显示,水牛PTH蛋白分布在细胞质(26.1%)、线粒体(21.7%)、细胞外(包括细胞壁)(17.4%)、内质网(13.0%)、细胞核(8.7%)、高尔基体(4.3%)和其他部位(8.7%),推测PTH蛋白可能在运输、结合及细胞被膜等方面发挥信号转导和转录调控作用。

分类号： Q811.4`S823.83

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