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白花草木樨EST-SSR标记的开发与筛选

文献类型: 中文期刊

作者: 剡转转;任艳;吴凡;骆凯;张代玉;闫启;张宇飞;赵玉凤;张吉宇

作者机构:

关键词: 草木樨;EST-SSR;标记开发;多态信息含量;期望杂合度;遗传距离;遗传多样性

期刊名称:草业科学

ISSN: 1001-0629

年卷期: 2017 年 9 期

页码: 1802-1814

摘要: 草木樨(Melilotus)是重要的豆科牧草之一,然而草木樨分子标记匮乏,限制了草木樨种质资源的开发与利用。本研究以白花草木樨(M.albus)转录组数据为基础,设计了18 182对草木樨EST-SSR引物,并对所开发的EST-SSR引物进行筛选。通过PCR扩增从550对EST-SSR引物中筛选得到206对白花草木樨多态性引物,共检测出679个等位基因,平均每对引物检测出2.888个基因位点。多态信息含量PIC的分布范围为0.239~0.855,平均值为0.468。206对多态性引物Nei’s基因多样性指数(H)和Shannon信息指数(I)的平均值分别为0.169和0.239。本研究开发的EST-SSR丰富了草木樨属的分子标记,为研究种质资源的遗传多样性和分子辅助育种奠定了基础。

分类号: S541.9

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