数字农科院2.0

一种高效筛选Mx GTPase效应区SNP方法

文献类型： 中文期刊

作者： 尹春光;秦宏伟;彭浩;王晓强;杜立新;赵桂苹

作者机构：

关键词： Mx;二次PCR-SSCP;GED区;SNP

期刊名称：生物技术

ISSN： 1004-311X

年卷期： 2018 年 2 期

页码： 130-135

收录情况： 科技核心（2020版）

摘要： [目的]建立高效检测家禽Mx功能区SNP方法 ,改进PCR SSCP。[方法]以引进品种和地方品种为研究对象,筛选引物,优化程序,通过二次PCR改进SSCP方法对Mx基因GTPase效应区SNP进行检测。[结果]SSCP检测引物分型检测及SNP分析,检测结果与测序一致。来航鸡检测到阳性结果,且PA检测的多态位点均由编码区A/G替换引起,济宁百日鸡和来航鸡两个群体PIC为0.2515和0.2628,呈低度多态。[结论]χ~2独立性检验位点基因频率和基因型频率呈Hardy-Weinberg平衡,不同品种间位点8(S631N)基因型分布差异极显著(P<0.01)。改进后的PCR SSCP高效经济简便,为高通量后期检测、新位点筛选奠定基础。

分类号： Q78`S831

  • 相关文献

[1]中国部分地方鸡品种Mx基因部分区域多态性分析及表达研究. 尹春光,杜立新,赵桂平,魏彩虹,李宏滨,王晓强. 2009

[2]禽类抗病毒蛋白质—Mx蛋白. 尹春光,杜立新. 2007

[3]绵羊Y染色体基因鉴定及其与父系起源的研究进展. 谢云龙,秦芳,李万宏,李发弟,乐祥鹏. 2017

[4]高邮鸭IGF-1基因SNP位点变异与骨骼肌生长发育相关性分析. 陶志云,朱春红,宋卫涛,徐文娟,刘宏祥,章双杰,李慧芳. 2016

[5]猪EPOR基因结构、遗传变异及连锁不平衡分析. 张龙超,王立贤,赵克斌,颜华. 2009

[6]牛SCD1基因C878T位点遗传多态性与中国西门塔尔牛部分脂肪相关性状的效应分析. 武秀香,施雪奎,常玲玲,杨章平,李俊雅,毛永江,高会江. 2011

[7]利用SNP标记估计西门塔尔牛亲缘关系系数的准确性. 张静静,高会江,吴洋,朱波,齐欣,高雪,张路培,陈燕. 2016

[8]NPY、IGF-1基因对文昌鸡繁殖性状的遗传效应. 朱文奇,李慧芳,吴旭,钱凯,张晶鑫,葛洪伟. 2007

[9]神经肽(NPY)基因多态性与邵伯鸡母系繁殖性状的关联性分析. 黄华云,黎寿丰,赵振华,丁余荣,张静. 2010

[10]鸡脂肪酸脱氢酶基因多态性及其与脂肪酸含量的关联分析. 刘向萍,雷黎立,周琼,王克华,常国斌. 2010

[11]奶牛pIgR基因多态性及其对牛奶中IgA和IgM含量的影响. 张春刚,刘光磊,程金波,董晓丽,赵国琦,刘开朗,王加启,卜登攀. 2008

[12]西门塔尔牛饱和脂肪酸含量的低密度芯片基因组预测. 齐欣,张静静,樊惠中,李娟,胡鑫,刘飞,朱波,高雪,陈燕. 2016

[13]紫茎泽兰低温应答转录因子EaCBF1的克隆及不同地理种群的遗传差异分析. 程红梅,郭建英,万方浩. 2007

[14]基于茶树SNP的dCAPS标记体系研究. 张成才,王丽鸳,韦康,成浩,包云秀,刘本英,汪云刚. 2012

[15]牛Dmrt7基因的cDNA克隆及遗传变异. 淮亚红,许尚忠. 2009

[16]中国野生葡萄mybA转录因子SNP特征分析. 焦健,刘崇怀,樊秀彩,张颖,孙海生,姜建福,李民. 2013

[17]鸡NLRC5基因启动子多态性分析. 郭晓敏,刘向萍,常国斌,徐璐,马腾,王洪志,李志腾,陈静,万方. 2015

[18]甘蓝型油菜株高性状的全基因组关联分析. 唐敏强,程晓晖,童超波,刘越英,赵传纪,董彩华,于景印,马小艮,黄军艳,刘胜毅. 2015

[19]GNRHRI、GF-1基因对文昌鸡繁殖性状的遗传效应分析. 吴旭,王金玉,严美姣,李慧芳,陈宽维,汤青萍,朱文奇,俞亚波. 2007

[20]大刍草渐渗系雌穗表型统计及SNP分子标记开发. 曹立超,樊双虎,张春义,陈茹梅. 2014

作者其他论文 更多>>