数字农科院2.0

基于表达谱芯片筛选鸡不同部位皮肤组织差异表达基因

文献类型： 中文期刊

作者： 姬改革;束婧婷;单艳菊;章明;屠云洁;刘一帆;巨晓军;邹剑敏

作者机构：

关键词： 鸡;不同部位;皮肤;毛囊;表达谱芯片

期刊名称：畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2018 年 1 期

页码： 36-45

摘要： 旨在筛选鸡不同部位(背部和腿部)皮肤组织中的差异表达基因,探讨二者皮肤毛囊出现表型差异的分子机制。以处于上市日龄的(63日龄)商品代肉鸡为素材,利用Agilent鸡全基因组表达谱芯片对皮肤厚度、毛囊密度和直径出现显著差异的背部和腿部皮肤组织mRNA表达水平进行检测,对与皮肤毛囊发生发育相关的候选基因及信号通路进行系统筛查,并运用实时荧光定量PCR技术对部分差异表达基因进行验证。结果显示,芯片分析共筛选到差异表达基因676个(|FC|≥2,P<0.05),以腿部皮肤为参照,背部皮肤组织中上调基因223个,下调基因453个。荧光定量PCR验证部分差异表达基因的表达趋势与芯片结果基本一致。GO分析表明,差异表达基因参与细胞增殖和凋亡调控、Wnt信号通路、神经元分化、细胞间黏附调节、细胞命运的确定等生物学过程。KEGG信号通路分析发现,除了部分已知的与皮肤毛囊生长发育相关的信号通路(Wnt和Hedgehog信号通路),ECM受体相互作用、黏着、细胞黏附分子、黏合连接等信号通路也被富集。蛋白互作网络分析表明,这些差异表达基因相互作用形成一个调控网络,可能通过影响皮肤毛囊的生长发育和周期变化来影响皮肤毛囊的性状,推测ECM受体相互作用、黏着、运输等调控通路及DKK1、WNT3A、SHH、FGF1、IGF1等基因可能是参与鸡不同部位皮肤毛囊性状出现差异的重要调控通路和候选基因。

分类号： S831.2

  • 相关文献

[1]LncRNA在哺乳动物毛囊发育调控中的研究进展. 常永芳,包鹏甲,褚敏,吴晓云,梁春年,阎萍. 2019

[2]基于表达谱芯片挖掘鸡骨骼肌不同类型肌纤维的差异表达基因. 束婧婷,姬改革,单艳菊,章明,肖芹,屠云洁,盛中伟,张笛,邹剑敏. 2017

[3]烟粉虱不同发育阶段解毒代谢酶基因的特异性表达. 杨妮娜,张友军,杨鑫,黄大野,龙同,万鹏. 2016

[4]固氮斯氏假单胞菌全基因组测序和表达谱初步分析. 燕永亮,杨剑,窦岳坦,何升,李红权,平淑珍,彭俊平,王忆平,金奇,林敏. 2006

[5]基于表达谱芯片挖掘清远麻鸡和科宝肉鸡比目鱼肌差异表达基因. 束婧婷,章明,宋迟,单艳菊,徐文娟,宋卫涛,李慧芳. 2016

[6]利用RNAi和表达谱芯片分析日本血吸虫Sj34.9基因的功能. 刘萍萍,石艳丽,杨云霞,刘金明,林矫矫,金亚美. 2012

[7]不同类型鸡趾长伸肌中基因表达谱差异分析. 章明,束婧婷,屠云洁,姬改革,单艳菊,盛中伟,张笛,邹剑敏. 2016

[8]鹿茸发育的组织来源及其相互作用机制研究进展. 鲁晓萍,王大涛,孙红梅,褚文辉,赵海平,章秀婷,李春义. 2014

[9]绒山羊皮肤蛋白双向电泳条件的优化与常见问题分析. 高丽霞,刘志红,张燕军,王志新,杜琛,奈日乐,杜立新,李金泉. 2014

[10]真皮间充质干细胞的研究进展. 刘浩,关伟军,马月辉. 2015

[11]脂肪干细胞在伤口愈合中的作用研究进展. 王玉俗,褚文辉,王琦,李春义,赵全民. 2019

[12]利用冷冻切片法与石蜡切片法对水貂组织切片进行优化研究. 梁东,杨福合,邢秀梅,吴琼,刘汇涛,任二军. 2011

[13]β-catenin和BMP2基因在幼龄水貂皮肤中表达的研究. 王卓,李光玉,杨雅涵,张铁涛,张海华,孙皓然,孙伟丽. 2014

[14]天然色素和人工色素对肉仔鸡皮肤和脚胫颜色影响的研究. 王慧文,孙丰梅,杨曙明. 2012

[15]鹿茸皮肤完全再生机理的研究进展. 孙红梅,赵海平,李春义,丛培强. 2021

[16]超薄切片技术的优化及其在兽医研究中的应用. 史永红,陈秋生. 2022

[17]构建具有毛囊结构的组织工程皮肤及移植研究. 史明艳,高雪,杨学义,窦忠英,许尚忠. 2019

[18]维生素A对动物毛囊发育影响的研究进展. 南韦肖,司华哲,娄玉杰,李光玉. 2019

[19]初生水貂皮肤毛囊发育组织学观察. 王卓,李光玉,杨雅涵,张婷,黄健,周宁,孙伟丽. 2014

[20]牦牛胎儿皮肤毛囊的形态发生及E钙黏蛋白的表达和定位. 佘平昌,梁春年,裴杰,褚敏,郭宪,阎萍. 2016

作者其他论文 更多>>