猪ADAR1基因cDNA全长克隆、序列信息及组织表达分析
文献类型: 中文期刊
作者: 张跃博;欧阳峰正;王立刚;侯欣华;刘欣;颜华;张龙超;王立贤
作者机构:
关键词: ADAR1;表达;基因克隆;RACE;猪
期刊名称:畜牧兽医学报
ISSN: 0366-6964
年卷期: 2019 年 6 期
页码: 1135-1144
收录情况: 北大核心(2020版) ; CSCD(2020-2021年度) ; 农林核心(2020版) ; 科技核心(2020版)
摘要: 旨在克隆猪作用于RNA的腺苷脱氨酶1基因(ADAR1)cDNA全长序列,检测该基因在大白猪不同组织及不同日龄背膘中的表达情况.本研究利用RACE(rapid-amplification of cDNA ends)克隆大白猪ADAR1基因mRNA全长序列,并对其进行生物信息学分析;采用荧光定量PCR方法检测ADAR1在不同组织中的表达水平,并探究不同日龄背膘中ADAR1的表达规律.结果表明,猪ADAR1基因cDNA全长6 259 bp,编码1 145个氨基酸,与人、黑猩猩、猕猴、长臂猿、黄牛、山羊和绵羊的氨基酸序列一致性均不低于85%.该基因编码的蛋白具有2个Zα结合结构域,3个双链RNA结合结构域和1个脱氨酶结构域.ADAR1在心、肝、脾、肺、肾、脑、肌肉、小肠和背部脂肪组织以及7、60、120和180日龄个体背膘组织中均表达,其表达量总体上表现出随个体发育先下降后上升的趋势.综上所述,本研究成功克隆了猪ADAR1基因cDNA全长序列,发现其在猪体内广泛表达,并且在不同日龄猪背膘组织中表达水平存在差异,为今后深入研究ADAR1的功能奠定了理论基础.
分类号: S828.2
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