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基于SRY基因分析梅花鹿的遗传多样性及父系类型

文献类型： 中文期刊

作者： 董依萌;刘华淼;玉手英利;刘汇涛;鞠妍;邢秀梅;何金明;鞠贵春

作者机构：

关键词： 梅花鹿;SRY基因;遗传多样性;父系类型

期刊名称：中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2019 年 46 卷 2 期

页码： 489-496

收录情况： 北大核心（2020版） ; 农林核心（2020版） ; 科技核心（2020版）

摘要： 试验旨在研究梅花鹿SRY基因的遗传多样性及其父系类型.选取东北亚种、北海道亚种、本州亚种、指名亚种、屋久岛亚种5个亚种的144个个体,利用试剂盒和传统酚/仿(1:1)法进行DNA的提取,采用PCR扩增和直接测序法分析梅花鹿的核苷酸多样性(Pi)、单倍型多样性(H d)、遗传距离及系统进化关系.结果显示,试验所获序列长度为1613 bp,在第47、62、602、1148、1569、1604 bp处共检测到6个SNPs多态位点,占核苷酸总数的0.3%,碱基替换以碱基转换为主.通过6个SNPs多态位点确立了6种单倍型:Hap-1、Hap-2、Hap-3、Hap-4、Hap-5和Hap-6,其中Hap-4、Hap-5和Hap-6为新发现单倍型.遗传多样性由高至低依次为:指名亚种、屋久岛亚种、东北亚种、本州亚种、北海道亚种.各亚种间遗传距离最小为北海道亚种与本州亚种的距离(0.000056),最大为东北亚种与指名亚种的距离(0.001733).基于单倍型利用邻接法构建系统进化树,结果显示,与日本梅花鹿相比,东北亚种与马鹿关系更近,东北亚种存在两大分支,日本梅花鹿各亚种间无明显分支,其他单倍型均是由Hap-3进化而来,单倍型最小跨度网络图与系统进化树一致.结果表明,东北梅花鹿存在两大父系类型,日本梅花鹿存在一个父系类型,单倍型H ap-3是日本梅花鹿的原始单倍型.

分类号： S825

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